<div dir="ltr">Hello,<div><br></div><div>I ran the ft_readatlas function on a surface based atlas as follows for later parcellation:</div><div><br></div><div>atlas_left = ft_read_atlas({'lh.aparc.DKTatlas.annot','lh.white'}, 'format', 'freesurfer_aparc');<br>atlas_right = ft_read_atlas({'rh.aparc.DKTatlas.annot','rh.white'}, 'format', 'freesurfer_aparc');<br>atlas_right.aparc = atlas_right.aparc + 36;<br><br>atlas = atlas_left;<br>atlas.pos = cat(1,atlas.pos,atlas_right.pos);<br>atlas.tri = cat(1,atlas.tri,atlas_right.tri);<br>atlas.aparc = cat(1,atlas.aparc,atlas_right.aparc);<br>atlas.aparclabel = cat(1,atlas.aparclabel,atlas_right.aparclabel);<br>atlas.rgba = cat(1,atlas.rgba,atlas_right.rgba);<br>save('dkt_test','atlas')</div><div><br></div><div>I combined both outputs together to visualize both parcellated hemispheres in the same plot, but what I end up with is a messy superimposition of both hemispheres within each other. What is the more appropriate way to go about merging both left/right atlases together into one? I could not find a Fieldtrip function that does so (I am running the 2019 version).<br clear="all"><div><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><br></div>Thanks,<div>Michael</div><div>--</div><div><a href="mailto:mjhouston2@uh.edu" target="_blank">mjhouston2@uh.edu</a></div><div><font color="#ff0000">MSBE '20, University of Houston</font></div></div></div></div></div></div>