<div dir="ltr">Dear community,<div><br><div>1. When I make multiple comparisons based on cluster, does cfg.statistic  = 'ft_statfun_depsamplesT' refer to the test of each sample in the first step using  paired t-test? And cfg.method  = 'montecarlo' refers to the second cluster test using a permutation test?<br><br>2. If that's the case, and we didn't adjust for multiple comparisons in example 2 (cfg.correctm   = 'no'), then cfg.statistic   = 'ft_statfun_depsamplesT' is a paired t-test, and what is cfg.method  = 'montecarlo'?</div><div><br>3. If this is the case, I would like to use non-parametric tests such as the Wilcoxon test and Kruskal-Wallis test in the first step of each sample test, which parameter in the cfg should be modified?<br><br>Example 1:Cluster-based permutation in FieldTrip<br><br>cfg = [];<br>cfg.channel     = 'MEG';<br>cfg.neighbours  = neighbours; % defined as above<br>cfg.latency     = [0.3 0.7];<br>cfg.avgovertime = 'yes';<br>cfg.parameter   = 'avg';<br>cfg.method      = 'montecarlo';<br>cfg.statistic   = 'ft_statfun_depsamplesT';<br>cfg.alpha       = 0.05;<br>cfg.correctm    = 'cluster';<br>cfg.correcttail = 'prob';<br>cfg.numrandomization = 'all';  <br><br>Example 2:Permutation test based on t statistics in FieldTrip<br><br>cfg = [];<br>cfg.channel     = 'MEG';<br>cfg.latency     = [0.3 0.7];<br>cfg.avgovertime = 'yes';<br>cfg.parameter   = 'avg';<br>cfg.method      = 'montecarlo';<br>cfg.statistic   = 'ft_statfun_depsamplesT';<br>cfg.alpha       = 0.05;<br>cfg.correctm    = 'no';<br>cfg.correcttail = 'prob';<br>cfg.numrandomization = 'all'; <br></div></div><div><br></div><div>Best,<br>Zhipeng<br></div><div><br></div></div>