<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
Hi Giuseppe,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">If you open ft_sourcestatistics and read the help documentation, it states:</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">
<div class="">% FIXME the following needs to be reimplemented</div>
<div class="">%</div>
<div class="">% You can restrict the statistical analysis to regions of interest (ROIs)</div>
<div class="">% or to the average value inside ROIs using the following options:</div>
<div class="">%   cfg.atlas        = filename of the atlas</div>
<div class="">%   cfg.roi          = string or cell of strings, region(s) of interest from anatomical atlas</div>
<div class="">%   cfg.avgoverroi   = 'yes' or 'no' (default = 'no')</div>
<div class="">%   cfg.hemisphere   = 'left', 'right', 'both', 'combined', specifying this is required when averaging over regions</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">If I subsequently search the code for the term ‘roi’ or ‘avgoverroi’, I only get a hit for the occurrences in the help documention, so that means that there is no functional  consequence of specifying those options. </div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">In other words: it is not so surprising that it doesn’t work, at least not in the way that you implemented it in your scripts. This also means that the documentation you used to create your scripts is out of sync with the code. That’s unfortunate,
 and it would be helpful if propose a change to the website (it could be as minimal as inserting a disclaimer or so) that flags the non-functionality of that snippet of code (for the time being).</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">This being said, there have been various code/workflow improvements over the past years, which in principle would make it possible for you to achieve what you want, using a different route.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">This requires the use of ft_sourceparcellate (or ft_virtualchannel), followed by a call to ft_timelockstatistics/ft_freqstatistics. If the documentation online proves insufficient, then it would be helpful if you were to write a bit of documentation
 once you find out how to do it.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Good luck and best wishes,</div>
<div class="">Jan-Mathijs</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On 24 Aug 2022, at 15:53, Zito Giuseppe Angelo via fieldtrip <<a href="mailto:fieldtrip@science.ru.nl" class="">fieldtrip@science.ru.nl</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div class="WordSection1" style="page: WordSection1; caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;">
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: Arial, sans-serif;" class="">Dear Fieldtrip community,<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: Arial, sans-serif;" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: Arial, sans-serif;" class="">I would like to bring up the topic of ROI-based source analysis. I’ve seen that many have asked about this in the last years, but I could not find an answer that worked.<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: Arial, sans-serif;" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: Arial, sans-serif;" class="">I would like to restrict my ft_sourcestatistics to specific ROIs taken from the aal atlas. I implemented the code as suggested in other discussions/tutorials, but the results
 are identical to the ones obtained without ROI selection.<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: Arial, sans-serif;" class="">Could you please give me an advice on how to solve it?<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: Arial, sans-serif;" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: Arial, sans-serif;" class="">Here is my code:<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: Arial, sans-serif;" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">realPrePost{1} =<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">  struct with fields:<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">      freq: 5.5008<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">       cfg: [1×1 struct]<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">       dim: [15 18 15]<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">    inside: [4050×1 logical]<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">       pos: [4050×3 double]<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">    method: 'average'<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">       avg: [1×1 struct]<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: Arial, sans-serif;" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: Arial, sans-serif;" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(2, 128, 9);" class="">%<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(2, 128, 9);" class="">Prepare cfg
 to run the stats</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg                  = [];</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.dim              = realPrePost{1}.dim;</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.method           =<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(170, 4, 249);" class="">'montecarlo'</span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">;</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.statistic        =<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(170, 4, 249);" class="">'ft_statfun_indepsamplesT'</span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">;</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.parameter        =<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(170, 4, 249);" class="">'pow'</span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">;</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.correctm         =<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(170, 4, 249);" class="">'cluster'</span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">;</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.clusteralpha     = 0.05;</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.numrandomization = 10000;</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.alpha            = 0.05;</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.tail             = 0;</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(2, 128, 9);" class="">%<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(2, 128, 9);" class="">Atlas-related
 cfg options</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">aal = ft_read_atlas(</span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(170, 4, 249);" class="">'C:\toolbox\fieldtrip-20220317\template\atlas\aal\ROI_MNI_V4.nii'</span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">);</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.atlas        = aal;</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.roi          = aal.tissuelabel(63:64);</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.avgoverroi   =<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(170, 4, 249);" class="">'yes'</span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">;</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.hemisphere   =<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(170, 4, 249);" class="">'both'</span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">;<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(2, 128, 9);" class="">%
 'combined'</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(2, 128, 9);" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(2, 128, 9);" class="">%<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(2, 128, 9);" class="">Design matrix</span><span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(2, 128, 9);" class=""></span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">designMatrix = [];</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">designMatrix(1,1:nReal+nSham) = [ones(1,nReal) 2*ones(1,nSham)];</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.design = designMatrix;</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.ivar = 1;</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class=""></span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">stat = ft_sourcestatistics(cfg, realPrePost{:}, shamPrePost{:});</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class=""></span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(2, 128, 9);" class="">% Load and reslice MRI</span><span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(2, 128, 9);" class=""><span class="Apple-converted-space"> </span>template</span><span lang="EN-GB" style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">mri = ft_read_mri(</span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(170, 4, 249);" class="">'C:\toolbox\fieldtrip-20220317\template\anatomy\single_subj_T1_1mm.nii'</span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">);</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">mri = ft_volumereslice([], mri);</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class=""></span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg            = [];</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.downsample = 2;</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.parameter  =<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(170, 4, 249);" class="">'stat'</span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">;</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">statPlot  = ft_sourceinterpolate(cfg, stat, mri);</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class=""></span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(2, 128, 9);" class="">% Plot source</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">close<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(170, 4, 249);" class="">all</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">maxval = max(statPlot.stat);</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class=""></span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg = [];</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.method        =<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(170, 4, 249);" class="">'ortho'</span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">;</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.funparameter  =<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(170, 4, 249);" class="">'stat'</span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">;</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.maskparameter = cfg.funparameter;</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.funcolorlim   = [0.5 maxval];</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.opacitylim    = [0.5 maxval];</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">cfg.opacitymap    =<span class="Apple-converted-space"> </span></span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New"; color: rgb(170, 4, 249);" class="">'rampup'</span><span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">;</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: "Courier New";" class="">ft_sourceplot(cfg, statPlot);</span><span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 12pt; font-family: "Courier New";" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: Arial, sans-serif;" class="">Any help would be appreciated,<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 10pt; font-family: Arial, sans-serif;" class="">Giuseppe<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10pt; font-family: Arial, sans-serif;" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div class="MsoNormal" style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; background-color: white;">
<span lang="DE-CH" style="font-size: 10pt; font-family: Arial, sans-serif;" class="">
<hr size="2" width="100%" align="left" class="">
</span></div>
</div>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 2.4pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; background-color: white;">
<b class=""><span lang="EN-GB" style="font-size: 12pt; font-family: Arial, sans-serif;" class="">Dr. Giuseppe Angelo Zito</span></b><span lang="EN-GB" style="font-size: 12pt; font-family: Arial, sans-serif; color: rgb(34, 34, 34);" class=""><o:p class=""></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 2.4pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; background-color: white;">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 9.5pt; font-family: Arial, sans-serif; color: rgb(89, 89, 89);" class="">Principal Investigator, Swiss National Science Foundation<o:p class=""></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 2.4pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; background-color: white;">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 9.5pt; font-family: Arial, sans-serif; color: rgb(89, 89, 89);" class=""><o:p class=""> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 2.4pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; background-color: white;">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 9.5pt; font-family: Arial, sans-serif; color: rgb(89, 89, 89);" class="">Decision Neuroscience Lab<o:p class=""></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 2.4pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; background-color: white;">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 9.5pt; font-family: Arial, sans-serif; color: rgb(89, 89, 89);" class="">Department of Health Sciences and Technology (D-HEST)<o:p class=""></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 2.4pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; background-color: white;">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 9.5pt; font-family: Arial, sans-serif; color: rgb(89, 89, 89);" class="">ETH – Swiss Federal Institute of Technology Zurich<o:p class=""></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 2.4pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; background-color: white;">
<span lang="FR-CH" style="font-size: 9.5pt; font-family: Arial, sans-serif; color: rgb(89, 89, 89);" class=""><o:p class=""> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 2.4pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; background-color: white;">
<span lang="FR-CH" style="font-size: 9.5pt; font-family: Arial, sans-serif; color: rgb(89, 89, 89);" class="">Winterthurerstrasse 190<o:p class=""></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 2.4pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; background-color: white;">
<span lang="FR-CH" style="font-size: 9.5pt; font-family: Arial, sans-serif; color: rgb(89, 89, 89);" class="">8057 Zürich<o:p class=""></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 2.4pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; background-color: white;">
<span lang="FR-CH" style="font-size: 9.5pt; font-family: Arial, sans-serif; color: rgb(89, 89, 89);" class="">Switzerland<o:p class=""></o:p></span></p>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 9.5pt; font-family: Arial, sans-serif;" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 9.5pt; font-family: Arial, sans-serif; color: rgb(89, 89, 89);" class="">Tel: +41 44 633 05 17<o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span lang="EN-GB" style="font-size: 9.5pt; font-family: Arial, sans-serif; color: rgb(89, 89, 89);" class="">mailto:<span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:giuseppeangelo.zito@hest.ethz.ch" class="">giuseppeangelo.zito@hest.ethz.ch</a><o:p class=""></o:p></span></div>
<div style="margin: 0cm; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<span style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; float: none; display: inline !important;" class="">_______________________________________________</span><br style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<span style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; float: none; display: inline !important;" class="">fieldtrip
 mailing list</span><br style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" style="font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<a href="https://urldefense.com/v3/__https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202__;!!HJOPV4FYYWzcc1jazlU!5XqTR4XAv-0LkbWpXqVYKB9EFohXB0-iGQ2XmHrhHTHTO5KztgBk42By40VmIFTymbtSjwffiL29v2K0aVyhPIUTmP1-6L68GVQhww$" style="font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">https://urldefense.com/v3/__https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202__;!!HJOPV4FYYWzcc1jazlU!5XqTR4XAv-0LkbWpXqVYKB9EFohXB0-iGQ2XmHrhHTHTO5KztgBk42By40VmIFTymbtSjwffiL29v2K0aVyhPIUTmP1-6L68GVQhww$</a><span style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; float: none; display: inline !important;" class=""><span class="Apple-converted-space"> </span> </span></div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
</body>
</html>