<div dir="ltr">Dear Fieldtrip,<br><br>As part of my research I am using fieldtrip to do connectivity analysis. But I am really struggling to get my code working.If someone is able to help me with the question below it would be a great help.<br><br>Basically what I want to understand, what each field of the output of 'ft_sourceanalysis' means, especially 'trial.filter'.<br><br><br>My intermediate output structure and configurations are shown below. It is a 108 channel 50001 sample EEG time series.<br><br><br><br><br>data<br>-----<br><br>    sampleinfo: [1 50001]<br>       fsample: 5000<br>          elec: [1×1 struct]<br>           hdr: [1×1 struct]<br>         trial: {[108×50001 double]}<br>          time: {[1×50001 double]}<br>         label: {108×1 cell}<br>           cfg: [1×1 struct]<br><br><br>timelock<br>--------<br>cfg = [];<br>cfg.channel = 'EEG';<br>cfg.vartrllength = 2;<br>cfg.covariance = 'yes';<br>cfg.covariancewindow = 'all';<br>cfg.keeptrials = 'yes';<br><br>timelock = ft_timelockanalysis(cfg, data);<br><br>timelock = <br>  struct with fields:<br><br>      time: [1×50001 double]<br>     label: {108×1 cell}<br>      elec: [1×1 struct]<br>     trial: [1×108×50001 double]<br>    dimord: 'rpt_chan_time'<br>       cov: [1×108×108 double]<br>       cfg: [1×1 struct]<br><br><br><br>leadfield<br>---------<br>grid = ft_prepare_leadfield( cfg, timelock);<br><br>grid = <br>  struct with fields:<br><br>                pos: [6804×3 double]<br>               unit: 'mm'<br>                dim: [18 21 18]<br>             inside: [6804×1 logical]<br>                cfg: [1×1 struct]<br>          leadfield: {1×6804 cell}<br>              label: {108×1 cell}<br>    leadfielddimord: '{pos}_chan_ori'<br><br><br>source analysis<br>-----------------<br>cfg = [];<br>cfg.channel = 'EEG';<br>cfg.method = 'lcmv';<br>cfg.sourcemodel = grid;<br>cfg.headmodel = vol;<br>cfg.rawtrial = 'yes';<br>cfg.lcmv.keepfilter = 'yes';<br>cfg.keepleadfield = 'yes';<br>cfg.lcmv.projectnoise = 'yes';<br>cfg.lcmv.lambda = '2%';<br>source = ft_sourceanalysis( cfg, timelock);<br><br>source = <br>  struct with fields:<br><br>               time: [1×50001 double]<br>                cfg: [1×1 struct]<br>                dim: [18 21 18]<br>             inside: [6804×1 logical]<br>              label: {108×1 cell}<br>          leadfield: {1×6804 cell}<br>    leadfielddimord: '{pos}_chan_ori'<br>                pos: [6804×3 double]<br>             method: 'rawtrial'<br>              trial: [1×1 struct]<br>                 df: 1<br><br><br>I am trying to understand the content of source.trial(1).filter, which is a cell array of size{6804×1 cell}, each cell has metrics of size 3x108.<br><br><br>Thanks for your help in Advance.<br><br>Sajeev Kunjan<br>PhD Scholar, Flinders university<br>Adelaide, South Australia<br></div>