<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">

</head>

<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">

Hi all,

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">I have a question with respect to the ‘grad’ structure in my CTF MEG data. For a given participant, data acquisition was stopped and restarted, leading two (or more) raw data files, with only a short break in between. The participant did not leave

 the MEG in between.</div>

<div class="">I would like to append the two datasets to preprocess them together, as if they were acquired in a single run. I am wondering though how to deal with the grad structure, given that the ft_appenddata seems to remove it. I am guessing this is due

 to slight differences in the coil and chan pos/ori matrices, presumably a result of slight head movements. Up til now, I was simply using the first file’s grad structure, but I guess there should be a better way. Would the most straightforward way be to average

 the positions and orientations in the grad structures of each run to get at a grad structure for the appended dataset? I.e., would this be closest to the grad structure that I would have gotten if data acquisition wouldn’t have been interrupted? </div>

<div class="">Or should I realign each using ft_megrealign? Though I am guessing this is not what just doing acquisition in one run would lead to either.</div>

<div class=""><br class="">

</div>

<div class="">Thanks!</div>

<div class=""><br class="">

</div>

<br class="">

<div class="">

<div dir="auto" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; caret-color: rgb(0, 0, 0); color: rgb(0, 0, 0); word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">

<div><br class="Apple-interchange-newline">

---</div>

<div>Matthias Franken, PhD</div>

<div>Postdoctoral Researcher</div>

<div>Motor Neuroscience Lab</div>

<div>Department of Psychology</div>

<div>McGill University</div>

<div><br class="">

</div>

<div><a href="mailto:matthias.franken@mail.mcgill.ca" class="">matthias.franken@mail.mcgill.ca</a> </div>

<div><a href="https://frankenmatthias.github.io/homepage" class="">https://frankenmatthias.github.io/homepage</a> </div>

<div class=""><br class="">

</div>

</div>

<br class="Apple-interchange-newline" style="caret-color: rgb(0, 0, 0); color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;">

<br class="Apple-interchange-newline">

</div>

<br class="">

</body>

</html>