<html xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=Windows-1252">
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 15 (filtered medium)">
<style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
{font-family:"Cambria Math";
panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
{font-family:Calibri;
panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
{margin:0cm;
font-size:11.0pt;
font-family:"Calibri",sans-serif;}
.MsoChpDefault
{mso-style-type:export-only;}
@page WordSection1
{size:612.0pt 792.0pt;
margin:70.85pt 70.85pt 70.85pt 70.85pt;}
div.WordSection1
{page:WordSection1;}
--></style>
</head>
<body lang="FR" link="blue" vlink="#954F72" style="word-wrap:break-word">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal">Hi FieldTrip Community !</p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">I need your wisdom !</p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">I am trying to compute a time-frequency map of Granger causality for EEG data using a non parametric approach. To do so, I computed the Fourier Spectrum using the ‘mtmconvol’ method of ft_freqanalysis and I am now trying to feed it into
ft_connectivityanalysis using the ‘granger’ method. I get an error that I don’t understand.</p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Here is the freq structure I’m trying to force into ft_connectivityanalysis :</p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><i>freq =<o:p></o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><i> label: {2x1 cell}<o:p></o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><i> dimord: 'rpttap_chan_freq_time'<o:p></o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><i> freq: [1x64 double]<o:p></o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><i> time: [1x31 double]<o:p></o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><i> fourierspctrm: [4-D double]<o:p></o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><i> cumtapcnt: [1x64 double]<o:p></o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><i> cfg: [1x1 struct]<o:p></o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">How I use ft_connectivityanalysis :</p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><i>cfg = [];<o:p></o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><i>cfg.method = 'granger';<o:p></o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><i><o:p> </o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><i>granger = ft_connectivityanalysis(cfg, freq);<o:p></o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">And the error message Matlab displays :</p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal"><i>Error using zeros<o:p></o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><i>Size inputs must be integers.<o:p></o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><i><o:p> </o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><i>Error in sfactorization_wilson (line 63)<o:p></o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><i> S = cat(3, zeros(size(S,1), size(S,1), npad), S);<o:p></o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><i><o:p> </o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><i>Error in ft_connectivity_csd2transfer (line 181)<o:p></o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><i> [Htmp, Ztmp, Stmp] = sfactorization_wilson(tmp, freq.freq, ...<o:p></o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><i><o:p> </o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><i>Error in ft_connectivityanalysis (line 430)<o:p></o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><i> data = ft_connectivity_csd2transfer(data, optarg{:});<o:p></o:p></i></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Can you enlighten me on this issue ?</p>
<p class="MsoNormal">Thanks a lot for your help !</p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<p class="MsoNormal">Cheers,</p>
<p class="MsoNormal">Eva</p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
</body>
</html>