<div dir="ltr">Hello, I run a one-way within-subjects ANOVA with 4 conditions (Self, High, Mid and Low) in a cluster based permutation test.<div>To do so this was my code:</div><div><br></div><div><i>cd(indir)</i></div><div><i>load layout<br>load neighbours<br><br>cfg = [];<br>cfg.parameter        = 'avg';<br>cfg.latency          = [0 0.5];<br>cfg.method           = 'montecarlo';<br>cfg.statistic        = 'depsamplesT';<br>cfg.correctm         = 'cluster';<br>cfg.clusteralpha     = 0.05;<br>cfg.clusterstatistic = 'maxsum';<br>cfg.minnbchan        = 2;<br>cfg.tail             = 0;<br>cfg.clustertail      = 0;<br>cfg.alpha            = 0.05;<br>cfg.numrandomization = 10000;<br>cfg.correcttail = 'prob';<br><br>cfg.layout = layout;<br>cfg.neighbours = neighbours;<br><br>load Self<br>load High<br>load Mid<br>load Low<br><br>cfg.statistic='depsamplesFmultivariate';<br><br>subj = 2*length(subarray);<br>design = zeros(2,4*subj);<br>for i = 1:subj<br>    design(1,i) = i;<br>end<br>for i = 1:subj<br>    design(1,subj+i)=i;<br>end<br>for i = 1:subj<br>    design(1,subj*2+i)=i;<br>end<br>for i = 1:subj<br>    design(1,subj*3+i)=i;<br>end<br><br>design(2,1:subj)=1; design(2,subj+1:2*subj)=2; design(2,2*subj+1:3*subj)=3; design(2,3*subj+1:4*subj)=4;<br>cfg.design = design;<br>cfg.ivar=2; cfg.uvar=1;<br><br>cfg.clusterthreshold='nonparametric';<br>ERP_oneway_condition=ft_timelockstatistics(cfg, Self{:}, High{:}, Mid{:}, Low{:});<br>save ([indir 'ERP_oneway_condition.mat'], 'ERP_oneway_condition')</i><br></div><div><br></div><div>When I was running my code I get the following message: </div><div>"<i>total number of variables = 2</i></div><div><i>number of independent variables = 1</i></div><div><i>number of unit variables = 1</i></div><div><i>number of within-cell variables = 0</i></div><div><i>number of control variables = 0</i>"</div><div><br></div><div>My question is: Is it normal that when doing a within-subjects anova the number of within-cell variables is 0? Is this correct?</div><div><br></div><div>Thanks for any input!</div><div><br></div><div>Best,</div><div>Martina</div></div>