<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; line-break: after-white-space;" class="">
Hi Bushra,
<div class=""><br class="">
<div class="">
<div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">
<div style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
Thank you for your reply. I am stuck with this for couple of days now.</div>
</div>
</blockquote>
<div><br class="">
</div>
Welcome to science.</div>
<div><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">
<div style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
 ><span style="margin: 0px; font-size: 9pt; font-family: "Segoe UI", "Segoe UI Web (West European)", "Segoe UI", -apple-system, system-ui, Roboto, "Helvetica Neue", sans-serif; color: rgb(32, 31, 30); background-color: rgb(255, 255, 255);" class=""><i class="">Can
 you please specify the cfg to ft_freqstatistics as well? Otherwise, we don’t know what you did exactly.</i></span></div>
<div style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
<i style="font-size: 12pt; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">
<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;" class="">
cfg<span class="x_Apple-converted-space" style="margin: 0px;">           <span class=""> </span></span>= [];</div>
<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;" class="">
cfg.method =<span class=""> </span><span class="x_s1" style="margin: 0px; color: rgb(160, 32, 240);">'montecarlo'</span>;</div>
<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier; color: rgb(160, 32, 240);" class="">
<span class="x_s2" style="margin: 0px;">cfg.statistic =<span class=""> </span></span>'indepsamplesZcoh'<span class="x_s2" style="margin: 0px;">;</span></div>
<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;" class="">
cfg.design(1,1:148)=1;</div>
<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;" class="">
cfg.design(1,149:296)=2;</div>
<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;" class="">
cfg.numrandomization = 1000;</div>
<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;" class="">
cfg.correctm<span class=""> </span><span class="x_Apple-converted-space" style="margin: 0px;">       <span class=""> </span></span>=<span class=""> </span><span class="x_s1" style="margin: 0px; color: rgb(160, 32, 240);">'cluster'</span>;</div>
<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;" class="">
cfg.neighbours=[];</div>
<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;" class="">
cfg.parameter=<span class="x_s1" style="margin: 0px; color: rgb(160, 32, 240);">'crsspctrm'</span>;</div>
<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;" class="">
cfg.alpha<span class="x_Apple-converted-space" style="margin: 0px;">           <span class=""> </span></span>= 0.05;</div>
<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;" class="">
cfg.clusteralpha<span class=""> </span><span class="x_Apple-converted-space" style="margin: 0px;">   <span class=""> </span></span>= 0.05;</div>
<div style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;" class="">
stat=ft_freqstatistics(cfg,freq_coh);</div>
</i>
<div style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
<br class="">
</div>
Sorry I didnt follow this point. I am calling freqstatistics with above cfg parameters</div>
</div>
</blockquote>
<div><br class="">
</div>
<div>To reiterate, you need to use cfg.parameter = ‘fourierspctrm’, and (cfg.output = ‘fourier’ when calling ft_freqanalysis). The low-level ft_statfun_indepsamplesZcoh assumes that the input data are fourier coefficients.</div>
<div><br class="">
</div>
<div>Next, as a disclaimer: I think that indepsamplesZcoh has hardly been used recently, so it could very well be that it’s functional behavior has not been kept up-to-date with the state of the rest of the toolbox.</div>
<br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">
<div style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
<span style="margin: 0px; font-size: 9pt; font-family: "Segoe UI", "Segoe UI Web (West European)", "Segoe UI", -apple-system, system-ui, Roboto, "Helvetica Neue", sans-serif; color: rgb(32, 31, 30); background-color: rgb(255, 255, 255);" class=""><i class="">>Also,
 ft_freqstatistics with cfg.statistic = ’indepsamplesZcoh’ requires frequency data that has been computed with >‘fourier’ rather than ‘powandcsd’ as cfg.method for ft_freqanalysis</i></span><br class="">
</div>
<div style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
<br class="">
</div>
<div style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
when freq_coh is calculated with fourier method, then above code give following error</div>
<div style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
<br class="">
</div>
<div style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
<span style="color: rgb(200, 38, 19); font-size: 9pt;" class="">Error using ft_freqstatistics (line 177)</span>
<div class=""><span style="color: rgb(200, 38, 19); font-size: 9pt;" class="">the length of the design matrix (1) does not match the number of observations in the data (2072)</span></div>
<span style="color: rgb(200, 38, 19); font-size: 9pt;" class=""> </span><br class="">
</div>
<div style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
<span style="margin: 0px; font-size: 12pt;" class="">It seems as if the dimord for fourier data is not read correctly, rpttap_chan_freq is getting confused with rpt_chan_freq as 2072 are rpttap , number of repetitions are only 296</span></div>
</div>
</blockquote>
<div><br class="">
</div>
<div>If you use multitaper spectral analysis, each ’trial’ (aka rpt) gets more than one taper assigned, in your case about 7. These are the number of columns in your data matrix, so that needs to be reflected in the design. Therefore, the design have 2072 columns.
 In addition, for the randomization to be done correctly, you need to specify in the design, which columns belong to the same trial. So you need to define a second column consisting of [1 1 … 1 2 2 .. 2 …296] coding the individual trials. Then you need to appropriately
 set the cfg.ivar=1, and cfg.wvar=2 -> please consult the documentation on the fieldtrip website for this.</div>
<div>In addition you may need to specify cfg.origdim = [1 numel(freq_coh.freq)], and cfg.connectivity = false; before calling ft_freqstatistics. </div>
<div><br class="">
</div>
<div>Moreover, you may need to comment out lines 127 and 150 in ft_statfun_indepsamplesZcoh.m</div>
<div><br class="">
</div>
<div>I hope that this will help you on your way, to get it resolved for you. Perhaps you could filie a Pull Request on our github repository with the required change to ft_statfun_indepsamplesZcoh. Also it would be superhelpful for the rest of the community,
 if your experiences will be solidified in an example script that can be hosted on: <a href="https://www.fieldtriptoolbox.org/example/" class="">https://www.fieldtriptoolbox.org/example/</a></div>
<div><br class="">
</div>
<div>Best wishes,</div>
<div>Jan-Mathijs</div>
<div><br class="">
</div>
<div><br class="">
</div>
<div><br class="">
</div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">
<div style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
<span style="margin: 0px; font-size: 12pt;" class=""><br class="">
</span></div>
<div style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
The error can be reproduced by running following script</div>
<div style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
<a href="https://urldefense.com/v3/__https://www.dropbox.com/s/7bupsr8gkdmy28c/testcode.m?dl=0__;!!HJOPV4FYYWzcc1jazlU!og3YlDTnQJXpbwiNKFrIAwklgaHzW9Gkdlv-WeCI05whozlcD9pwXXXbKggQyxNDb85XDPxE$" id="LPlnk432436" class="">https://www.dropbox.com/s/7bupsr8gkdmy28c/testcode.m?dl=0</a><br class="">
</div>
<div style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
with this data</div>
<div style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
<a href="https://urldefense.com/v3/__https://www.dropbox.com/s/6gfj97srttteawy/Coh_data.mat?dl=0__;!!HJOPV4FYYWzcc1jazlU!og3YlDTnQJXpbwiNKFrIAwklgaHzW9Gkdlv-WeCI05whozlcD9pwXXXbKggQyxNDb1di9xyl$" target="_blank" rel="noopener noreferrer" data-auth="NotApplicable" data-linkindex="0" style="margin: 0px; background-color: rgb(255, 255, 255);" class="">https://www.dropbox.com/s/6gfj97srttteawy/Coh_data.mat?dl=0</a><br class="">
</div>
<div style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
<br class="">
</div>
<div style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
Thank you </div>
<div style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
Kind regards</div>
<div style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;" class="">
Bushra Riaz</div>
<div id="appendonsend" style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
</div>
<hr tabindex="-1" style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; display: inline-block; width: 1063.296875px;" class="">
<span style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; float: none; display: inline !important;" class=""></span>
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr" style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<font face="Calibri, sans-serif" style="font-size: 11pt;" class=""><b class="">From:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>fieldtrip <<a href="mailto:fieldtrip-bounces@science.ru.nl" class="">fieldtrip-bounces@science.ru.nl</a>> on behalf of Schoffelen,
 J.M. (Jan Mathijs) <<a href="mailto:jan.schoffelen@donders.ru.nl" class="">jan.schoffelen@donders.ru.nl</a>><br class="">
<b class="">Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>18 May 2021 14:05<br class="">
<b class="">To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>FieldTrip discussion list <<a href="mailto:fieldtrip@science.ru.nl" class="">fieldtrip@science.ru.nl</a>><br class="">
<b class="">Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Re: [FieldTrip] Error using indepsamplesZcoh function for calculating coherence differences</font>
<div class=""> </div>
</div>
<div class="" style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; word-wrap: break-word; line-break: after-white-space;">
Hi Bushra,
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Can you please specify the cfg to ft_freqstatistics as well? Otherwise, we don’t know what you did exactly.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Also, ft_freqstatistics with cfg.statistic = ’indepsamplesZcoh’ requires frequency data that has been computed with ‘fourier’ rather than ‘powandcsd’ as cfg.method for ft_freqanalysis</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Best wishes,</div>
<div class="">Jan_Mathijs</div>
<div class=""><br class="">
<div class=""><br class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On 14 May 2021, at 13:36, Bushra Riaz Syeda <<a href="mailto:bushra.riaz@gu.se" class="">bushra.riaz@gu.se</a>> wrote:</div>
<br class="x_Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div class="" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
<span class="" style="font-family: calibri, arial, helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; background-color: rgba(0, 0, 0, 0);">Hello,</span></div>
<div class="" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
<span class="" style="font-family: calibri, arial, helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; background-color: rgba(0, 0, 0, 0);">I am trying to do the analysis based on the paper </span><span class="" style="font-family: calibri, arial, helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; background-color: rgba(0, 0, 0, 0);"><span class="" style="font-variant-ligatures: inherit; font-variant-caps: inherit;">"nonparametric
 statistical testing of coherence differences" in fieldtrip for comparing differences between two conditions on single subject level.</span></span></div>
<div class="" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
<span class="" style="font-size: 12pt; font-variant-ligatures: inherit; font-variant-caps: inherit;"><br class="">
</span></div>
<div class="" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
<span class="" style="font-family: calibri, arial, helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; background-color: rgba(0, 0, 0, 0);"><span class="" style="font-variant-ligatures: inherit; font-variant-caps: inherit;">I am using the following code</span></span></div>
<div class="" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
<span class="" style="font-family: calibri, arial, helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; background-color: rgba(0, 0, 0, 0);"><span class="" style="font-variant-ligatures: inherit; font-variant-caps: inherit;"><br class="">
</span></span></div>
<div class="" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
<i class="" style="font-size: 12pt; font-variant-ligatures: inherit; font-variant-caps: inherit; font-weight: inherit;">
<div class="" style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;">
cfg<span class="x_Apple-converted-space">           <span class="x_Apple-converted-space"> </span></span>= [];</div>
<div class="" style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;">
cfg.method =<span class="x_Apple-converted-space"> </span><span class="x_s1" style="color: rgb(160, 32, 240);">'montecarlo'</span>;</div>
<div class="" style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier; color: rgb(160, 32, 240);">
<span class="x_s2">cfg.statistic =<span class="x_Apple-converted-space"> </span></span>'indepsamplesZcoh'<span class="x_s2">;</span></div>
<div class="" style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;">
cfg.design(1,1:148)=1;</div>
<div class="" style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;">
cfg.design(1,149:296)=2;</div>
<div class="" style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;">
cfg.numrandomization = 1000;</div>
<div class="" style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;">
cfg.correctm<span class="x_Apple-converted-space"> </span><span class="x_Apple-converted-space">       <span class="x_Apple-converted-space"> </span></span>=<span class="x_Apple-converted-space"> </span><span class="x_s1" style="color: rgb(160, 32, 240);">'cluster'</span>;</div>
<div class="" style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;">
cfg.neighbours=[];</div>
<div class="" style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;">
cfg.parameter=<span class="x_s1" style="color: rgb(160, 32, 240);">'crsspctrm'</span>;</div>
<div class="" style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;">
cfg.alpha<span class="x_Apple-converted-space">           <span class="x_Apple-converted-space"> </span></span>= 0.05;</div>
<div class="" style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;">
cfg.clusteralpha<span class="x_Apple-converted-space"> </span><span class="x_Apple-converted-space">   <span class="x_Apple-converted-space"> </span></span>= 0.05;</div>
<div class="" style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;">
stat=ft_freqstatistics(cfg,freq_coh);</div>
<br class="">
</i></div>
<div class="" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
<i class="" style="font-size: 12pt; font-variant-ligatures: inherit; font-variant-caps: inherit; font-weight: inherit;"><br class="">
</i></div>
<div class="" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
<span class="" style="font-family: calibri, arial, helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; background-color: rgba(0, 0, 0, 0);"><span class="" style="font-variant-ligatures: inherit; font-variant-caps: inherit;">Where freq_coh is calculated as</span></span></div>
<div class="" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
<span class="" style="font-size: 12pt; font-variant-ligatures: inherit; font-variant-caps: inherit;">
<div class="" style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;">
cfg<span class="x_Apple-converted-space">           <span class="x_Apple-converted-space"> </span></span>= [];</div>
<div class="" style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;">
cfg.output<span class="x_Apple-converted-space"> </span><span class="x_Apple-converted-space">   <span class="x_Apple-converted-space"> </span></span>=<span class="x_Apple-converted-space"> </span><span class="x_s1" style="color: rgb(160, 32, 240);">'powandcsd'</span>;</div>
<div class="" style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;">
cfg.method<span class="x_Apple-converted-space"> </span><span class="x_Apple-converted-space">   <span class="x_Apple-converted-space"> </span></span>=<span class="x_Apple-converted-space"> </span><span class="x_s1" style="color: rgb(160, 32, 240);">'mtmfft'</span>;</div>
<div class="" style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;">
cfg.foilim<span class="x_Apple-converted-space"> </span><span class="x_Apple-converted-space">   <span class="x_Apple-converted-space"> </span></span>= [1 40];</div>
<div class="" style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;">
cfg.tapsmofrq<span class="x_Apple-converted-space"> <span class="x_Apple-converted-space"> </span></span>= 2;</div>
<div class="" style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;">
cfg.pad =<span class="x_Apple-converted-space"> </span><span class="x_s1" style="color: rgb(160, 32, 240);">'nextpow2'</span>;</div>
<div class="" style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;">
cfg.keeptrials =<span class="x_Apple-converted-space"> </span><span class="x_s1" style="color: rgb(160, 32, 240);">'yes'</span>;</div>
<div class="" style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;">
freq_coh<span class="x_Apple-converted-space">         <span class="x_Apple-converted-space"> </span></span>= ft_freqanalysis(cfg, Coh_data);</div>
<div class="" style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;">
<br class="">
</div>
<div class="" style="margin: 0px; font-variant-ligatures: normal; font-variant-caps: normal; font-variant-east-asian: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;">
<span class="" style="font-family: calibri, arial, helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; background-color: rgba(0, 0, 0, 0);">I am getting the following error</span></div>
<div class="" style="margin: 0px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier;">
<br class="">
</div>
<div class="x_p1" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; font-stretch: normal; font-size: 10px; line-height: normal; font-family: Courier; margin: 0px;">
Error using ft_statistics_montecarlo (line 250)
<div class="">could not determine the parametric critical value for clustering</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Error in ft_freqstatistics (line 194)</div>
  [stat, cfg] = statmethod(cfg, dat, design);<br class="">
</div>
<br class="">
</span></div>
<div class="" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
<span class="" style="font-size: 12pt; font-variant-ligatures: inherit; font-variant-caps: inherit;">Sample data can be found at the following link</span></div>
<div class="" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
<span class="" style="font-size: 12pt; font-variant-ligatures: inherit; font-variant-caps: inherit;"><a href="https://urldefense.com/v3/__https://www.dropbox.com/s/6gfj97srttteawy/Coh_data.mat?dl=0__;!!HJOPV4FYYWzcc1jazlU!rzdciE12ryfrSpIQp-4LAZj3EK_9U0i1XJby6k79PqsvZKuG4jrCMN-qjHXKDzonA-cj5upg$" id="LPlnk" class="">https://www.dropbox.com/s/6gfj97srttteawy/Coh_data.mat?dl=0</a><br class="">
</span></div>
<div class="x__EReadonly_1 x__EType_OWALinkPreview x__Entity x__EId_OWALinkPreview" style="font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; text-decoration: none;">
<div id="LPBorder_GTaHR0cHM6Ly93d3cuZHJvcGJveC5jb20vcy82Z2ZqOTdzcnR0dGVhd3kvQ29oX2RhdGEubWF0P2RsPTA." class="x_LPBorder553869" style="width: 800px; margin-top: 16px; margin-bottom: 16px; max-width: 800px; min-width: 424px;">
<table id="LPContainer553869" role="presentation" class="" style="padding: 12px 36px 12px 12px; width: 750px; border: 1px solid rgb(200, 200, 200); border-top-left-radius: 2px; border-top-right-radius: 2px; border-bottom-right-radius: 2px; border-bottom-left-radius: 2px;">
<tbody class="">
<tr valign="top" class="" style="border-spacing: 0px;">
<td class="">
<div id="LPImageContainer553869" class="" style="margin-right: 12px; height: 160px; overflow: hidden;">
<a target="_blank" id="LPImageAnchor553869" href="https://urldefense.com/v3/__https://www.dropbox.com/s/6gfj97srttteawy/Coh_data.mat?dl=0__;!!HJOPV4FYYWzcc1jazlU!rzdciE12ryfrSpIQp-4LAZj3EK_9U0i1XJby6k79PqsvZKuG4jrCMN-qjHXKDzonA-cj5upg$" class=""><img id="LPThumbnailImageId553869" alt="" height="160" width="160" class="" src="https://www.dropbox.com/static/images/spectrum-icons/generated/content/content-unknown-large.png" style="display: block;"></a></div>
</td>
<td class="" style="width: 568px;">
<div id="LPTitle553869" class="" style="font-size: 21px; font-weight: 300; margin-right: 8px; font-family: wf_segoe-ui_light, "Segoe UI Light", "Segoe WP Light", "Segoe UI", "Segoe WP", Tahoma, Arial, sans-serif; margin-bottom: 12px;">
<a target="_blank" id="LPUrlAnchor553869" href="https://urldefense.com/v3/__https://www.dropbox.com/s/6gfj97srttteawy/Coh_data.mat?dl=0__;!!HJOPV4FYYWzcc1jazlU!rzdciE12ryfrSpIQp-4LAZj3EK_9U0i1XJby6k79PqsvZKuG4jrCMN-qjHXKDzonA-cj5upg$" class="" style="text-decoration: none;">Coh_data.mat</a></div>
<div id="LPDescription553869" class="" style="font-size: 14px; max-height: 100px; color: rgb(102, 102, 102); font-family: wf_segoe-ui_normal, "Segoe UI", "Segoe WP", Tahoma, Arial, sans-serif; margin-bottom: 12px; margin-right: 8px; overflow: hidden;">
Shared with Dropbox</div>
<div id="LPMetadata553869" class="" style="font-size: 14px; font-weight: 400; color: rgb(166, 166, 166); font-family: wf_segoe-ui_normal, "Segoe UI", "Segoe WP", Tahoma, Arial, sans-serif;">
<a href="https://urldefense.com/v3/__http://www.dropbox.com__;!!HJOPV4FYYWzcc1jazlU!rzdciE12ryfrSpIQp-4LAZj3EK_9U0i1XJby6k79PqsvZKuG4jrCMN-qjHXKDzonA7PXFKq_$" class="">www.dropbox.com</a></div>
</td>
</tr>
</tbody>
</table>
</div>
</div>
<br class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; text-decoration: none;">
<div class="" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
<span class="" style="font-size: 12pt; font-variant-ligatures: inherit; font-variant-caps: inherit; font-weight: inherit;">any help would be highly appreciated</span></div>
<div class="" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
<span class="" style="font-size: 12pt; font-variant-ligatures: inherit; font-variant-caps: inherit; font-weight: inherit;">Kind regards</span></div>
<div class="" style="font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; text-decoration: none; font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt;">
Bushra Riaz</div>
<span class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; text-decoration: none; float: none; display: inline !important;">_______________________________________________</span><br class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; text-decoration: none;">
<span class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; text-decoration: none; float: none; display: inline !important;">fieldtrip
 mailing list</span><br class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; text-decoration: none;">
<a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px;">https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; text-decoration: none;">
<a href="https://urldefense.com/v3/__https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202__;!!HJOPV4FYYWzcc1jazlU!rzdciE12ryfrSpIQp-4LAZj3EK_9U0i1XJby6k79PqsvZKuG4jrCMN-qjHXKDzonA0G39K1J$" class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px;">https://urldefense.com/v3/__https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202__;!!HJOPV4FYYWzcc1jazlU!rzdciE12ryfrSpIQp-4LAZj3EK_9U0i1XJby6k79PqsvZKuG4jrCMN-qjHXKDzonA0G39K1J$</a><span class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; text-decoration: none; float: none; display: inline !important;"></span></div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
</div>
<span style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; float: none; display: inline !important;" class="">_______________________________________________</span><br style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<span style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; float: none; display: inline !important;" class="">fieldtrip
 mailing list</span><br style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" style="font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none;" class="">
<a href="https://urldefense.com/v3/__https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202__;!!HJOPV4FYYWzcc1jazlU!og3YlDTnQJXpbwiNKFrIAwklgaHzW9Gkdlv-WeCI05whozlcD9pwXXXbKggQyxNDbwSy0ZCd$" style="font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">https://urldefense.com/v3/__https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202__;!!HJOPV4FYYWzcc1jazlU!og3YlDTnQJXpbwiNKFrIAwklgaHzW9Gkdlv-WeCI05whozlcD9pwXXXbKggQyxNDbwSy0ZCd$</a><span style="caret-color: rgb(0, 0, 0); font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; text-decoration: none; float: none; display: inline !important;" class=""></span></div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
</div>
</body>
</html>