<div dir="ltr">Dear Umberto,<div><br></div><div>I'm guessing that your problem would be related with the analysis level you would like to conduct. In other words, I understand that you want to compare conditions (within subjects). I would suggest you to check the "cfg.keepindividuals" option prior to call ft_grandaverage. Also, if the data structure is appropriate for statistical analysis, I would recommend to check design matrix you have.</div><div><br></div><div>Best wishes,</div><div>Mustafa</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">Cavallo, Umberto (Stud. FPN) <<a href="mailto:u.cavallo@student.maastrichtuniversity.nl">u.cavallo@student.maastrichtuniversity.nl</a>>, 2 Nis 2021 Cum, 19:30 tarihinde şunu yazdı:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">




<div dir="ltr" style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);background-color:rgb(255,255,255);font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">
<p>Dear all,<br>
</p>
<p>I am interested in looking differences in the pupil size between two conditions (and the related ERP). <br>
</p>
<p>I am analyzing my pilot data and after the appropriate preprocessing i have timelocked my data through ft_timelockanalysis. <br>
</p>
<p>Then as suggested by Fieldtrip tutorials, i have computed the grand average for each condition for all subject using ft_timelockgrandaverage. <br>
</p>
<p>Finally i am using ft_statistics to test. <br>
</p>
<p>However, the structure obtained by ft_timelockgrandaverage is not suited for ft_statistics (hopefully i am wrong). <br>
</p>
<p>Thus, i ask you if to compute statistical tests through fieldtrip data should be maintained as they are after ft_titimelock (without computing the grand average across subjects) or if it is possible to use the data already averaged for all subjects (by ft_grandaverage). <br>
</p>
<p>I have read the tutorials and i could not find any suggestion or example. Probably i was unlucky or blind, but thanks for your help anyway. <br>
</p>
<p>Best, <br>
</p>
<p>Umberto <br>
</p>
</div>

_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" rel="noreferrer" target="_blank">https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
<a href="https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202" rel="noreferrer" target="_blank">https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202</a><br>
</blockquote></div><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature"><div dir="ltr"><b>Mustafa Yavuz </b><div><br></div><div><div style="color:rgb(136,136,136)">M.Sc. in Neuroscience</div><div style="color:rgb(136,136,136)">RA in HUBAL Neuroimaging Unit </div><div style="color:rgb(136,136,136)">Department of Neuroscience </div><div style="color:rgb(136,136,136)">İstanbul University </div></div></div></div>