<div dir="ltr"><div>Hi Jan-Mathijs,</div><div><br></div><div>Thank you very much for your response.</div><div><br></div><div>I defined the dipole positions with a regular 3D grid, with a dimension of 17*20*17 (following <a href="https://www.fieldtriptoolbox.org/tutorial/sourcemodel/">https://www.fieldtriptoolbox.org/tutorial/sourcemodel/</a>). This gives me 5780 grid points in total, with 2982 grid points inside of the brain.</div><div><br></div><div>You mentioned that 'the neighbourhood is implicit in their order', so can I do the following for the searchlight type of analysis:</div><div>(1) select only the activation of the 2982 grid points</div><div>(2) conduct analysis to every 10 grid points that are next to each other</div><div>(3) loop through all the 2982 grid points</div><div><br></div><div>Thank you again for your input!</div><div>Lin</div><div><br></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Fri, 19 Mar 2021 at 03:57, Schoffelen, J.M. (Jan Mathijs) <<a href="mailto:jan.schoffelen@donders.ru.nl">jan.schoffelen@donders.ru.nl</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">



<div style="overflow-wrap: break-word;">
Hi Lin,
<div><br>
</div>
<div>The answer to your question depends on the topology of the source space.</div>
<div>If the dipole positions are defined on a regular 3D grid, the neighbourhood is implicit in their order.</div>
<div>If the dipole positions are defined on a cortical mesh (that includes a triangulation), the neighbourhood can be determined from the triangulation.</div>
<div><br>
</div>
<div>Best wishes,</div>
<div>Jan-Mathijs</div>
<div><br>
<div><br>
<blockquote type="cite">
<div>On 18 Mar 2021, at 01:59, Lin Wang <<a href="mailto:wanglinsisi@gmail.com" target="_blank">wanglinsisi@gmail.com</a>> wrote:</div>
<br>
<div>
<div dir="ltr">
<div style="margin:0in;font-family:Calibri;font-size:11pt">Hi field excerpts,</div>
<div style="margin:0in;font-family:Calibri;font-size:11pt"><br>
</div>
<div style="margin:0in;font-family:Calibri;font-size:11pt">I'd like to implement a searchlight type of multivariate analysis in the MEG source localized data, but I don’t know where to find the information about neighboring voxels for each voxel.</div>
<div style="margin:0in;font-family:Calibri;font-size:11pt"><br>
</div>
<div style="margin:0in;font-family:Calibri;font-size:11pt">I guess this is also relevant to the definition of the neighborhood when conducting cluster-based permutation tests in the source space.</div>
<div style="margin:0in;font-family:Calibri;font-size:11pt"><br>
</div>
<div style="margin:0in;font-family:Calibri;font-size:11pt">Could anyone help me?</div>
<div style="margin:0in;font-family:Calibri;font-size:11pt"><br>
</div>
<div style="margin:0in;font-family:Calibri;font-size:11pt">Thank you very much!</div>
<div style="margin:0in;font-family:Calibri;font-size:11pt">Lin</div>
</div>
_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
<a href="https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202" target="_blank">https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202</a><br>
</div>
</blockquote>
</div>
<br>
</div>
</div>

_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" rel="noreferrer" target="_blank">https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
<a href="https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202" rel="noreferrer" target="_blank">https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202</a><br>
</blockquote></div></div>