<div dir="ltr"><div>I don't believe you automatically need to apply a correction just because you're making several comparisons against the same standard. The important issue is whether these multiple comparisons are testing the same research question. If all of these are testing the same question, and getting a significant result on any one of them would allow you to say "yes, my theory was right!", then you would need to correct accordingly. (This is the reason correction for multiple comparisons is needed with ERP data in the first place; if you perform a t-test at every millisecond and getting a significant result at any particular sample would let you say "look, I got an MMN!", then that would cause a big multiple comparisons problem.) However, if they are testing distinct questions then, as far as I understand, correction isn't necessary. <br clear="all"></div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><br></div><span><div>---<br></div>Stephen Politzer-Ahles<br>The Hong Kong Polytechnic University<br>Department of Chinese and Bilingual Studies<br><a href="http://www.polyu.edu.hk/cbs/sjpolit/" target="_blank">http://www.polyu.edu.hk/cbs/sjpolit/</a></span></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div><br></div><br><div class="gmail_quote"><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
<br>
Message: 1<br>
Date: Fri, 1 Jan 2021 16:34:58 +1100<br>
From: Arti Abhishek <<a href="mailto:mailtome.2113@gmail.com" target="_blank">mailtome.2113@gmail.com</a>><br>
To: FieldTrip discussion list <<a href="mailto:fieldtrip@science.ru.nl" target="_blank">fieldtrip@science.ru.nl</a>><br>
Subject: [FieldTrip] Question of cluster based permutation test<br>
Message-ID:<br>
        <CA+N_CJqXU+d70-CfUxLMai+=<a href="mailto:FaHCxds2hhZw%2BwS0SXrrps-ubQ@mail.gmail.com" target="_blank">FaHCxds2hhZw+wS0SXrrps-ubQ@mail.gmail.com</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"<br>
<br>
Dear fieldtrip community,<br>
<br>
I have a question on cluster based permutation tests where one condition is<br>
compared with multiple other conditions. My experiment is a MMN<br>
multi-deviant paradigm where I have 4 deviants and one standard. I want to<br>
compare each deviant with the standard using the cluster stats to check the<br>
presence of MMN. Do I have to apply any correction as the same standard<br>
condition is compared multiple times?  My script is below:<br>
<br>
cfg                             = [];<br>
<br>
cfg.channel                     = {'EEG'};<br>
<br>
cfg.spmversion                  = 'spm12';<br>
<br>
cfg.latency                     = [-100 600];<br>
<br>
cfg.method                      = 'montecarlo';<br>
<br>
cfg.statistic                   = 'depsamplesT';<br>
<br>
cfg.correctm                    = 'cluster';<br>
<br>
cfg.clusteralpha                = 0.05;<br>
<br>
cfg.clusterstatistic            = 'maxsum';<br>
<br>
cfg.minnbchan                   = 2;<br>
<br>
cfg.tail                        = 0;<br>
<br>
cfg.clustertail                 = 0;<br>
<br>
cfg.alpha                       = 0.025;<br>
<br>
cfg.numrandomization            = 5000;<br>
<br>
cfg_neighb.layout               = lay;<br>
<br>
cfg_neighb.method               = 'triangulation';<br>
<br>
cfg.neighbours                  = ft_prepare_neighbours(cfg_neighb);<br>
<br>
%cfg.neighbours                 = neighbours;<br>
<br>
cfg.uvar                        = 1;<br>
<br>
cfg.ivar                        = 2;<br>
<br>
cfg.design                      = [1:19 1:19; ones(1,19) 2*ones(1,19)];<br>
<br>
Stat_MMN1                       = ft_timelockstatistics(cfg,<br>
All_Dev1{:},All_Std{:});<br>
<br>
Stat_MMN2                       = ft_timelockstatistics(cfg,<br>
All_Dev2{:},All_Std{:});<br>
<br>
Stat_MMN3                       = ft_timelockstatistics(cfg,<br>
All_Dev3{:},All_Std{:});<br>
<br>
Stat_MMN4                       = ft_timelockstatistics(cfg,<br>
All_Dev4{:},All_Std{:});<br>
<br>
Kind regards,<br>
Arti<br></blockquote><div> </div></div></div>