<div dir="ltr">Hi 

Stephen,<div>thank you for the quick reply, having a data structure which is baseline corrected is exactly what I want. </div><div>The other question concerns the frequency-band specific baseline-correction. As a first step I computed TFR representation of the entire frequency spectrum (i.e. from 8 HZ to 180 HZ), since I am interested in inspecting the data in this spectrum (In this case applying the baseline-correction just before plotting is ok). From this data structure  I subsequently extract different frequency-bands by cutting the data (TFRwavedata) at different frequencies (e.g 12 Hz, 30 Hz and so on) in order to obtain four different matrices of interest each one representing a band-specific power spectrum. Finally, I average the power over the frequencies of each band in order to obtain the estimation of the power in that band. In the latter case, according to my understanding, I should apply the baseline-correction after computing the average power of each frequency-band, so that the relative "band specific power" in each time bin is the ratio between the power averaged over all the frequencies belonging to that band and the power averaged over all the same frequencies in the baseline period. I would like to know if the procedure is correct and how to implement it in fieldtrip. I am going to check ft_freqbaseline as you kindly suggested me.</div><div>Thank for the help</div><div>Best</div><div>Marta</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">Il giorno lun 14 set 2020 alle ore 16:00 Stephen Whitmarsh <<a href="mailto:stephen.whitmarsh@gmail.com">stephen.whitmarsh@gmail.com</a>> ha scritto:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hi Marta,<div><br></div><div>It's not clear from your question whether you do or do not want to baseline correct power before plotting - with which I assume you mean not doing it in the plotting functions but instead creating a data structure which has had baseline correction applied. If so, ft_freqbaseline is what you are looking for. If not, then I am afraid I do not understand that part of the question.</div><div>Regarding the question whether or not you should apply a baseline correction, that would depend on what you want to do. "My final goal is to extract different frequency-bands" is not specific enough to really give an informed response to that.</div><div><br></div><div>Best,</div><div>Stephen</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">Op ma 14 sep. 2020 om 15:32 schreef Marta Andujar <<a href="mailto:marta.andujar@uniroma1.it" target="_blank">marta.andujar@uniroma1.it</a>>:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">Dear all, <div>I am performing a time-frequency decomposition via Morlet's Wavelet. My question is very basic and it concerns the estimation of the power. I went through different tutorials, and I am a bit confused about the normalization. In every tutorial I saw, the normalization is implemented before plotting the results.I am using the 'relative' option, so that for each frequency of interest and for each time-bin, the power is expressed as the ratio between the raw power and the power averaged over the baseline period. However, I would like to have my TRF results expressed as relative power before plotting. Is there a way to get what I am looking for? Or should I write my own code in order to get the relative power? My final goal is to extract different frequency-bands, and I guess that for each of these I should normalize against the power averaged both over the baseline period and over the frequencies defining the band of interest. Is it correct?</div><div>Thank you in advance</div><div>Marta</div></div>

<br>
<div style="font-size:1.3em"><font size="2"><span style="color:rgb(34,34,34);font-family:Verdana,sans-serif;background-color:rgb(255,255,255)">________________________________________________________</span></font></div><font size="1"><span style="color:rgb(34,34,34);font-family:Verdana,sans-serif;background-color:rgb(255,255,255)">Le informazioni contenute in questo messaggio di posta elettronica sono strettamente riservate e indirizzate esclusivamente al destinatario. Si prega di non leggere, fare copia, inoltrare a terzi o conservare tale messaggio se non si è il legittimo destinatario dello stesso. Qualora tale messaggio sia stato ricevuto per errore, si prega di restituirlo al mittente e di cancellarlo permanentemente dal proprio computer.</span><br style="color:rgb(34,34,34);font-family:Verdana,sans-serif;background-color:rgb(255,255,255)"><span style="color:rgb(34,34,34);font-family:Verdana,sans-serif;background-color:rgb(255,255,255)">The information contained in this e mail message is strictly confidential and intended for the use of the addressee only.  If you are not the intended recipient, please do not read, copy, forward or store it on your computer. If you have received the message in error, please forward it back to the sender and delete it permanently from your computer system.</span></font><div><hr></div>
<br>
<img src="https://drive.google.com/uc?id=1jSNW-wN76rZklfkg4rwweBp5lrX6mO9g">_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" rel="noreferrer" target="_blank">https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
<a href="https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202" rel="noreferrer" target="_blank">https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202</a><br>
</blockquote></div>
_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" rel="noreferrer" target="_blank">https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
<a href="https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202" rel="noreferrer" target="_blank">https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202</a><br>
</blockquote></div>

<br>
<div style="font-size:1.3em"><font size="2"><span style="color:rgb(34,34,34);font-family:Verdana,sans-serif;background-color:rgb(255,255,255)">______________________________<wbr>__________________________</span></font></div><font size="1"><span style="color:rgb(34,34,34);font-family:Verdana,sans-serif;background-color:rgb(255,255,255)">Le informazioni contenute in questo messaggio di posta elettronica sono strettamente riservate e indirizzate esclusivamente al destinatario. Si prega di non leggere, fare copia, inoltrare a terzi o conservare tale messaggio se non si è il legittimo destinatario dello stesso. Qualora tale messaggio sia stato ricevuto per errore, si prega di restituirlo al mittente e di cancellarlo permanentemente dal proprio computer.</span><br style="color:rgb(34,34,34);font-family:Verdana,sans-serif;background-color:rgb(255,255,255)"><span style="color:rgb(34,34,34);font-family:Verdana,sans-serif;background-color:rgb(255,255,255)">The information contained in this e mail message is strictly confidential and intended for the use of the addressee only.  If you are not the intended recipient, please do not read, copy, forward or store it on your computer. If you have received the message in error, please forward it back to the sender and delete it permanently from your computer system.</span></font><div><hr></div>
<br>
<img src="https://drive.google.com/uc?id=1jSNW-wN76rZklfkg4rwweBp5lrX6mO9g">