<div dir="ltr"><div dir="ltr">Hello,<br><br>I am attempting to run connectivity analysis on resting-state EEG data.  <b>My goal of source space analysis is to run <i>ft_networkanalysis</i> and extract graph theory variables. </b>I am following the "whole-brain connectivity and network analysis" tutorial.  I believe I have successfully navigated the tutorial (after importing my cleaned data from EEGlab) until I experience errors when I get to the 'connectivity analysis and parcellation'.<br><br>I can't find the atlas_MMP1.0_4k.mat file so I tried to use AllAreas_v17.mat.<br><br></div><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div>  % compute connectivity</div></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div>    cfg         = [];</div></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div>    cfg.method  ='coh';</div></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div>    cfg.complex = 'absimag';</div></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div>    source_conn = ft_connectivityanalysis(cfg, source);</div></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div>   </div></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div>    load AllAreas_v17.mat;</div></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div>    atlas.pos = source_conn.pos; </div></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div>   </div></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div>    cfg = [];</div></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div>    cfg.parcellation = 'parcellation';</div></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div>    cfg.parameter    = 'cohspctrm';</div></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div>    parc_conn = ft_sourceparcellate(cfg, source_conn, atlas);</div></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div><br></div></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div>    figure;imagesc(parc_conn.cohspctrm);</div></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div><br></div></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div><br></div></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div>Error using ft_checkdata (line 528)</div></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div>This function requires parcellation data as input, see ft_datatype_parcellation.</div></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div><br></div></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div>Error in ft_sourceparcellate (line 97)</div></blockquote><blockquote style="margin:0 0 0 40px;border:none;padding:0px"><div>parcellation = ft_checkdata(parcellation, 'datatype', 'parcellation', 'parcellationstyle', 'indexed');</div></blockquote></blockquote><div dir="ltr"><div><br></div><div><div>If there is an email thread already, please direct me to the proper post.  </div><div><br></div><div>I appreciate any help.  I have been stuck at this part for a while and would love to move through my analysis.</div><div><br></div><div>Thank you,</div><div>Rebecca </div><div><br></div></div></div></div>