<div dir="ltr">Dear FieldTripers,<div><br></div><div>Hope everyone is coping well with the current situation.</div><div><br></div><div>I am relatively new in fieldtrip and I have been long stuck with using ft_channelrepair for quite sometime now.</div><div><br></div><div>Briefly about my analysis pipeline:</div><div>1- Loading and epoching the data</div><div>2- ft_preprocessing - filtering, baselining, CAR</div><div>3- ft_databrowser - marking bad channels </div><div><font color="#000000" style="background-color:rgb(252,229,205)">4. ft_rejectvisual - rejecting bad channels; keepchannel = 'repair'</font></div><div><font color="#000000" style="background-color:rgb(252,229,205)">5. ft_channelrepair</font></div><div>6. ICA </div><div>7. TF Analysis</div><div>8. TF statististics</div><div><br></div><div>I have problems pertaining to step 4 and 5. In step 4 I want to keep the bad channels so that I can interpolate them in the next step. When I use data browser to look thorough the data, the bad channels look okay. But the problem starts when I perform ICA on them. My first observation is that the wchange value is very big (looks like this : 257868.69202720), but ICA runs completely. However the ICA component topoplots look weird (screenshots attached). However, when I look through the icabrowser plots , there are peaks at physiological frequencies. </div><div><br></div><div>In order to avoid this, I tried getting rid of the bad channels completely using ft_rejectvisual, perform ICA and then get back the missing channels using neighbourhood average. Doing this, I was able to perform TF analysis, but when I wanted to apply statistics on the data, I had errors. Finally, I had to avoid the entire step of  interpolation to be able to run everything and also perform statistics. But in a long run, I cannot avoid this step.</div><div><br></div><div>I am finding no clue as to where is it going wrong. </div><div><br></div><div>Hence, any idea, any clue from you all would help me very much. I am happy to provide with more details if necessary.</div><div>Thank you so much for your response.</div><div><br></div><div>Best regards,</div><div><br></div><div><div><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr">Kinkini Bhadra</div><div dir="ltr">PhD student</div><div>Department of Fundamental Neurosciences</div><div dir="ltr">University of Geneva</div><div dir="ltr"><br><div><b><br></b></div></div></div></div></div></div></div></div></div>