<div dir="ltr">Dear HeYuxin,<div><br></div><div>Welcome to FieldTrip!</div><div><br></div><div>I saw that Julian just gave a better solution than what I was writing you, so let me just leave you my preamble:</div><div><br></div><div>I assume you have done some cluster analyses over channels, frequencies and time point. In other words, you might have clusters spanning over three dimensions. Some channels might not be part of the cluster at some time points, some frequencies not at certain channels, etc. etc. So you will first have to decide what you want to look at. For instance: channels that at <i>any </i>point and at <i>any </i>frequency were part of a cluster? That might not be easy to interpret - what does a 'significant channel' mean in this case? Since you say you are new in FieldTrip, I'd like to offer some advise that might be useful here, perhaps also for others:</div><div><br></div><div>- Don't <i>start </i>with cluster-analyses, especially not over multiple dimensions.</div><div>- First explore your hypothesis more directly. Your hypothesis probably is not 'any effect at any time in any frequency in any channel'. Try to be more precise, e.g.: at what frequencies do you expect your effect. And at what time-period?</div><div>- If you can average over a dimension, do it. I.e. if you expect a certain frequency band (e.g. alpha 8-14Hz) to show an effect, average over that dimension. You can even do this in ft_freqanalysis.<br></div><div><div></div></div><div>- Try to avoid more than 2 dimensions in cluster-analyses. It makes interpretation (and plotting!) much easier.</div><div>- If you absolutely need to explore 3 dimensions, you can plot the results using ft_clusterplot. </div><div><div></div><div>- <a href="http://www.fieldtriptoolbox.org/faq/how_not_to_interpret_results_from_a_cluster-based_permutation_test/">Reading this</a> might help understand also how you would need to report cluster-analyses statistics, and the limitations of their interpretation.</div><div>- To summarize: <i>Cluster analyses is meant to deal with the multiple comparison problem, not a lack of precision in your hypotheses</i>. I do not say this to be pedantic, but to help you avoid becoming trapped in a circular multidimensional analyses chasing false positives, let alone risking unconsciously p-hacking and HARKing.  </div><div><br></div><div>I hope this helps!</div><div><br></div><div>Best wishes,</div><div>Stephen</div><div><br></div><div><br></div></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">Op wo 25 mrt. 2020 om 08:43 schreef 赫雨欣 <<a href="mailto:hyxer1998@163.com">hyxer1998@163.com</a>>:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:UICTFontTextStyleBody;font-size:17px"></span><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:UICTFontTextStyleBody;font-size:17px">Dear fieldtrip users:</span><br style="color:rgb(0,0,0);font-family:UICTFontTextStyleBody;font-size:17px"><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:UICTFontTextStyleBody;font-size:17px">I just started to use fieldtrip and I have a trivial question asking for help. </span><br style="color:rgb(0,0,0);font-family:UICTFontTextStyleBody;font-size:17px"><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:UICTFontTextStyleBody;font-size:17px">I’m trying to find out the labels of the sensors belonging to the significant clusters. I think maybe I can find some threads in stat.posclusterslabelmat or stat.negclusterslabelmat and in stat.mask but  they are all in three dimensions chan_freq_time, I don’t know how to do it exactly in codes. </span><br style="color:rgb(0,0,0);font-family:UICTFontTextStyleBody;font-size:17px"><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:UICTFontTextStyleBody;font-size:17px">Hope someone can help me. Thank you very much. </span><br style="color:rgb(0,0,0);font-family:UICTFontTextStyleBody;font-size:17px"><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:UICTFontTextStyleBody;font-size:17px">From HeYuxin</span><br><br><br><br><span title="neteasefooter"><p> </p></span>_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" rel="noreferrer" target="_blank">https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
<a href="https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202" rel="noreferrer" target="_blank">https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202</a><br>
</blockquote></div>