<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40"><head><meta http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=us-ascii"><meta name=Generator content="Microsoft Word 15 (filtered medium)"><!--[if !mso]><style>v\:* {behavior:url(#default#VML);}
o\:* {behavior:url(#default#VML);}
w\:* {behavior:url(#default#VML);}
.shape {behavior:url(#default#VML);}
</style><![endif]--><style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
{font-family:"Cambria Math";
panose-1:2 4 5 3 5 4 6 3 2 4;}
@font-face
{font-family:Calibri;
panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
{margin:0cm;
margin-bottom:.0001pt;
font-size:11.0pt;
font-family:"Calibri",sans-serif;
mso-fareast-language:EN-US;}
a:link, span.MsoHyperlink
{mso-style-priority:99;
color:#0563C1;
text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
{mso-style-priority:99;
color:#954F72;
text-decoration:underline;}
span.E-MailFormatvorlage17
{mso-style-type:personal-compose;
font-family:"Calibri",sans-serif;
color:windowtext;}
.MsoChpDefault
{mso-style-type:export-only;
font-family:"Calibri",sans-serif;
mso-fareast-language:EN-US;}
@page WordSection1
{size:612.0pt 792.0pt;
margin:70.85pt 70.85pt 2.0cm 70.85pt;}
div.WordSection1
{page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]--></head><body lang=EN-GB link="#0563C1" vlink="#954F72"><div class=WordSection1><p class=MsoNormal>Dear FieldTrip <span lang=DE>– Community,<o:p></o:p></span></p><p class=MsoNormal><span lang=DE><o:p> </o:p></span></p><p class=MsoNormal>I am using the wPLI routine from the FieldTrip toolbox to detect true connectivity.<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>However, I found that the wPLI values that I obtain are even higher than the coherence values and the maximum often goes up to 1.<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Based on the theory behind the two measures I would rather expect the opposite.<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal>Has anybody stumbled upon the same phenomenon?<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><img width=560 height=420 style='width:5.8281in;height:4.3697in' id="Grafik_x0020_2" src="cid:image003.png@01D5B4D1.2519CCB0"><o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal>Here is the code I used, Output_data contains 7 channels (samples x channels) and it is a continuous recording over 10 minutes which is truncated into 4 second trials:<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal> data.label = {'Ref'; 'PFCd'; 'PFCu'; 'dHC'; 'vHCu'; 'vHCd'; 'MD'};<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> data.fsample = 1000; <o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> j = 1;<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> for k = 1:20 <o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> data.time{k} = j:(k*30000);<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> data.trial{k} = Output_data((j:(k*30000)),:)';<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> j = k*30000 + 1;<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> end<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal> cfg.length = 4; <o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> cfg.overlap = 0.5; <o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> [data] = ft_redefinetrial(cfg, data);<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal> %% Freqanalysis to obtain the cross spectral density<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> cfg_freq = [];<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> cfg_freq.method = 'mtmfft';<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> cfg_freq.output = 'fourier';<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> cfg_freq.keeptrials = 'yes'; <o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> cfg_freq.taper = 'dpss';<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> cfg_freq.tapsmofrq = 2;<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> cfg_freq.foilim = [0 48];<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> cfg_freq.pad = 'nextpow2';<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> freq_data = ft_freqanalysis(cfg_freq, data);<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> <o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> %% coh analysis<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> cfg_conn = [];<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> cfg_conn.method = 'coh';<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> coh_str = ft_connectivityanalysis(cfg_conn, freq_data); <o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> coh_str = ft_checkdata(coh_str, 'cmbrepresentation', 'full','datatype','freq'); <o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> <o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> %% wPLI analysis<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> cfg_conn = [];<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> cfg_conn.method = 'wpli_debiased';<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> wpli_str = ft_connectivityanalysis(cfg_conn, freq_data); <o:p></o:p></p><p class=MsoNormal> wpli_str = ft_checkdata(wpli_str, 'cmbrepresentation', 'full','datatype','freq');<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal>Thank you very much and best regards<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p><p class=MsoNormal>Daniel<o:p></o:p></p><p class=MsoNormal><o:p> </o:p></p></div></body></html>