
<html><head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8"></head><body dir="auto"><div></div><div>Hey J,</div><div><br></div><div>this is just an educated guess since I don't really know how fieldtrip does the downsampling, but what is your sampling frequency and the sampling frequency you sample down to? Is it possible that your downsampling frequency is not a harmonic of your original sampling frequency (say 1000Hz to 300Hz)? Maybe there are NaNs for the new samples where fieldtrip can't find a corresponding one from the old sampling frequency?</div><div><br></div><div>Best of luck,</div><div>Erika</div><div><br>Am 17.07.2019 um 17:26 schrieb Jeremy Pulmano <<a href="mailto:jpulmano@princeton.edu">jpulmano@princeton.edu</a>>:<br><br></div><blockquote type="cite"><div><div dir="ltr"><div>Hi all,</div><div><br></div><div>I am new to both neuroscience and FieldTrip and am trying to debug my preprocessing pipeline of EEG data (biosemi .bdf files). These are the current steps:</div><div><ol><li style="margin-left:15px">High pass filtering</li><li style="margin-left:15px">Downsampling</li><li style="margin-left:15px">Epoching</li><li style="margin-left:15px">Base-line correction</li><li style="margin-left:15px">Re-referencing</li><li style="margin-left:15px">ICA / component rejection</li><li style="margin-left:15px">Visual artifact removal</li><li style="margin-left:15px">Low pass filter (I save the low pass filter for the end so that ICA yields better time course plots).</li></ol><div>However, after the first three steps (high pass, downsample, epoch), I continue to get the warning message: "Warning: data contains NaN values, no filtering or preprocessing applied," starting at baseline correction. It repeats itself over and over again. If I ignore these errors, the data looks incorrect in the end. Why does this happen, and how can I resolve this?</div></div><div><br></div><div>Any tips would be appreciated.</div><div><br></div><div>Thanks,</div><div>J</div></div>

</div></blockquote><blockquote type="cite"><div><span>_______________________________________________</span><br><span>fieldtrip mailing list</span><br><span><a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip">https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a></span><br><span><a href="https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202">https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202</a></span><br></div></blockquote></body></html>