<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8"><div dir="ltr">Hello everyone,<div><br></div><div>I am currently running a cluster-based permutation test on my TMS-EEG data and I saw something in the fieldtrip tutorial that I'm not sure how to interpret: according to the lines of code on the fieldtrip's website (<a href="http://www.fieldtriptoolbox.org/tutorial/cluster_permutation_timelock/">http://www.fieldtriptoolbox.org/tutorial/cluster_permutation_timelock/</a>), to decide which channels are to be highlighted in your topoplots aimed to characterize the region of a significant cluster you can use the 'all' command, thus implying that you consider a channel pertaining to the significant cluster if it is always active during the whole time window that you are looking at. Would anyone please let me know why 'all' is being used in this case instead of some alternative line of code simply highlighting channels that are part of the cluster and significantly changing at any given time during the analyzed interval?</div><div><br></div><div>I other words, in the referred link, the following code is used (e.g., in the "Within-subjects experiments" example, when the scalp maps are plotted):</div><div><i>   pos_int(i1) = all(pos(i2, m(k):m(k+1)), 2);<br></i></div><div><br></div><div>However, in this case, I would have thought that something like this would be more appropriate:</div><div><i>  </i><i> pos_int(i1) = sum(pos(i2, m(k):m(k+1)), 2)>0;</i></div><div><i><br></i></div><div>I wonder whether previous articles published using these tools have used the 'all' command to establish the channels considered to be part in a certain cluster?</div><div><br></div><div>Thanks in advance,</div><div>Jaime</div></div>