<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8"><div dir="ltr">Hello all, <div><br></div><div>My name is Soren Wainio-Theberge, and I'm working in the Mind, Brain Imaging and Neuroethics unit in Ottawa, Canada. I had a question about using cluster-based permutation tests with my data. I'm working with a large ECoG dataset, and I've grouped all the electrodes into regions according to an atlas. I wanted to do a cluster-based permutation test on the region-based results (since I have reason to suspect region-specific effects, but don't want to go as far as specifying a priori ROIs). However, since this is ECoG data each subject has only a subset of the full number of regions represented, depending on their electrode placement. As such, each region will have a different sample size. At the moment I'm only clustering across channels, not across time or time-frequency.</div><div><br></div><div>My fix was to permute each channel separately, rather than all together, which seems to work code-wise. My question is whether this a statistically sound thing to do - is the cluster test sensitive to differences in sample size for each region?<br></div><div><br></div><div>Best and thanks very much, </div><div>Soren Wainio-Theberge</div></div>