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</head><body lang="FR" link="blue" vlink="#954F72"><div class="WordSection1"><p class="MsoNormal">Hi Jan-Mathijs, <o:p></o:p></p><p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p><p class="MsoNormal">Thanks for you answer. I’ve looked at the time axis and still can’t figure out why I don’t get the time vector in the TF output.<o:p></o:p></p><p class="MsoNormal">I’ve tried differetn range of toi vectors.<o:p></o:p></p><p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p><p class="MsoNormal">        % Low-frequencies 2-30 Hz</p><p class="MsoNormal">        cfg              = [];</p><p class="MsoNormal">        cfg.output       = 'pow';</p><p class="MsoNormal">        cfg.method       = 'mtmfft';</p><p class="MsoNormal">        cfg.taper        = 'hanning';</p><p class="MsoNormal">        cfg.foi          = 2:2:30;                         % analysis 2 to 30 Hz in steps of 2 Hz / because deltaT=1/500ms=2 Hz</p><p class="MsoNormal">        cfg.t_ftimwin    = ones(length(cfg.foi),1).*0.5;   % length of time window = 0.5 sec</p><p class="MsoNormal">        cfg.toi          = -0.5:0.05:0.5;                    % time window "slides" from -1 to 1 sec in steps of 0.05 sec (50 ms)</p><p class="MsoNormal">        tfreq_Low_1{i} = ft_freqanalysis(cfg, erp);</p><p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p><p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p><p class="MsoNormal">My erp signal has the following time vector : </p><p class="MsoNormal">Time : 1x2151 points </p><p class="MsoNormal">I segmented my trials starting 1 s before the trigger onset and ending 1.1s after it. Data were sampled at 1024 Hz.</p><p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p><p class="MsoNormal">If I understand well, as I’ve got a 500ms Hanning window I have to stop my cfg.toi vector to a maximun of 1.1s-500ms. So the cfg.toi I used should be fine. </p><p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p><p class="MsoNormal">Moreover I get the Following warning message : « Warning: the trial definition in the configuration is inconsistent with the actual data ».</p><p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p><p class="MsoNormal">I’ve got a demo script analysis of data for the same processing pipeline, that give the same warning, but the ft_freqanalysis result contains a time vector.</p><p class="MsoNormal">So I don’t understand why I works in that case but not in mine. </p><p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p><p class="MsoNormal">Sorry for my « silly » questions.. </p><p class="MsoNormal">And thanks for your help.</p><p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p><p class="MsoNormal">Marion</p><p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p><p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p><p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p><p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p><p class="MsoNormal"><b><span style="color:#2F5597">Marion VINCENT</span></b><span style="color:black"><br>Eng., PhD , CNRS Research Engineer<br><b>Tel</b>: +33 607 59 46 76<br><br>Laboratoire SCALab UMR CNRS 9193<br>Université Lille 3<br>BP 60149<br>59653 Villeneuve d'Ascq Cedex<br><i>http://scalab.cnrs.fr</i><br>--------------------------------------------<br>L’Imaginarium / SCV-IrDIVE Equipex<br>99a Boulevard Descat<br>59200 Tourcoing<br><i>http://www.irdive.fr</i>/</span><o:p></o:p></p><p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p><div style="mso-element:para-border-div;border:none;border-top:solid #E1E1E1 1.0pt;padding:3.0pt 0cm 0cm 0cm"><p class="MsoNormal" style="border:none;padding:0cm"><b>De : </b><a href="mailto:jan.schoffelen@donders.ru.nl">Schoffelen, J.M. (Jan Mathijs)</a><br><b>Envoyé le :</b>mardi 5 mars 2019 11:37<br><b>À : </b><a href="mailto:fieldtrip@science.ru.nl">FieldTrip discussion list</a><br><b>Objet :</b>Re: [FieldTrip] ft_singleplotTFR issues.</p></div><p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p></div><br>
In this case, I don’t believe in coincidence. I suspect that the time axis in your ‘erp’ variable does not align well with the cfg.toi you try to extract with ft_freqanalysis,  in combination with the time-frequency window specified, which is longer (0.5 s)
 in the ‘low’ frequency case than in the ‘high’ frequency case.
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Jan-Mathijs</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
<div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On 5 Mar 2019, at 11:06, Marion Vincent <<a href="mailto:marion.vincent@univ-lille.fr" class="">marion.vincent@univ-lille.fr</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div class="WordSection1" style="page: WordSection1; font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Hi Jan-Mathijs,<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Thanks for your reply. I noticed there is no time matrix in the tfreq_Low  structure (from ft_freqanalysis(cfg, erp)).<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
But I can’t figure out why.<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
I’ve compared my erp matrix and my code for setting the ft_freqanalysis  parameters with ones from examples and it seems that my structures are welle shaped.<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Do you have any idea ?<span class="Apple-converted-space"> </span><o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Moreover I can’t figure out how my hig frequency analysis works fine compraed to the low frequency one. Maybe it worked by chance.<o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Thanks,</div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Marion</div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<b class=""><span style="color: rgb(47, 85, 151);" class="">Marion VINCENT</span></b><span style="" class=""><br class="">
Eng., PhD , CNRS Research Engineer<br class="">
<b class="">Tel</b>: +33 607 59 46 76<br class="">
<br class="">
Laboratoire SCALab UMR CNRS 9193<br class="">
Université Lille 3<br class="">
BP 60149<br class="">
59653 Villeneuve d'Ascq CedexI<br class="">
<i class=""><a href="http://scalab.cnrs.fr/" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class="">http://scalab.cnrs.fr</a></i><br class="">
--------------------------------------------<br class="">
L’Imaginarium / SCV-IrDIVE Equipex<br class="">
99a Boulevard Descat<br class="">
59200 Tourcoing<br class="">
<i class=""><a href="http://www.irdive.fr/" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class="">http://www.irdive.fr</a></i><a href="http://www.irdive.fr/" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class="">/</a></span><o:p class=""></o:p></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="border-style: solid none none; border-top-width: 1pt; border-top-color: rgb(225, 225, 225); padding: 3pt 0cm 0cm;" class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif; border: none; padding: 0cm;" class="">
<b class="">De :<span class="Apple-converted-space"> </span></b><a href="mailto:jan.schoffelen@donders.ru.nl" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class="">Schoffelen, J.M. (Jan Mathijs)</a><br class="">
<b class="">Envoyé le :</b>lundi 4 mars 2019 18:11<br class="">
<b class="">À :<span class="Apple-converted-space"> </span></b><a href="mailto:fieldtrip@science.ru.nl" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class="">FieldTrip discussion list</a><br class="">
<b class="">Objet :</b>Re: [FieldTrip] ft_singleplotTFR issues.</div>
</div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Hi Marion,<span class="Apple-converted-space"> </span><o:p class=""></o:p></div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
The assertion on line 177 (in the current version of the code this is line 178) of ft_singleplotTFR checks for the presence of a ‘freq’ and ‘time’ field in your data. It seems as if your data doesn’t meet this expectation. Hence the error.<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Jan-Mathijs<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
</div>
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
J.M.Schoffelen, MD PhD<br class="">
Senior Researcher, VIDI-fellow - PI, language in interaction<br class="">
Telephone: +31-24-3614793<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Physical location: room 00.028<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 12pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
Donders Centre for Cognitive Neuroimaging, Nijmegen, The Netherlands<o:p class=""></o:p></p>
</div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div class="">
<blockquote style="margin-top: 5pt; margin-bottom: 5pt;" class="">
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
On 4 Mar 2019, at 16:02, Marion Vincent <<a href="mailto:marion.vincent@univ-lille.fr" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class="">marion.vincent@univ-lille.fr</a>> wrote:<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Dear all,<span class="apple-converted-space"> </span><o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
I’m having some troubles using the ft_singleplotTFR for time-frequency analysis.<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
I’ve tried 2 different TF analysis : 'mtmfft' for low frequencies and ‘'mtmconvol'’ for high frequencies.<span class="apple-converted-space"> </span><o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
However I’ve got the Following error for the single plot of the low freq TF (but it works for high freq TF).<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
****************************<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Error using ft_singleplotTFR (line 177)<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
please use ft_singleplotER for time-only or frequency-only data<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
****************************<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Does anyone have any idea ? I’ve put the entire code below.<span class="apple-converted-space"> </span><o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Thanks !<span class="apple-converted-space"> </span><o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Marion<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
%% TIME-FREQUENCY ANALYSIS<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
close all<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
clear all<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
%% ************************ INITIALIZATION ******************<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
%% Parameters to change<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
EXP             =   '1';<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
seg_window      =   [1 1.1]; % in seconds %preStim/postStim<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
cond            = 1; % number of the experimental condition 1 to 4<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
Baseline_Window      = [-1 0] ; %as the baseline lasts 1s before the stimulus onset<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
%%  initialize fieldtrip<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
startup()<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
%% initialize paths<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
path_Biosemi  = 'C:\Users\Marion\Documents\EEG\Prosodie - Angele\AV-Exps';<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
path_data='C:\Users\Marion\Documents\MATLAB\EEG_AV-Exps';<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
%% subjects list<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
load(fullfile(path_data, 'data', 'Participants_List.mat'));<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
for i=1:27<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    subjects{i,1}=list_Participants(i);<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
end<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
clear list_Participants i<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
%% ************************ TIME-FREQUENCY DOMAIN ANALYSIS --- WANG et al. 2017 %%%%%%%%<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
% LOW FREQUENCIES: 2-30 Hz => Hanning multitaper %% fixed window length<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
% HIGH FREQUENCIES: 25-100 Hz => Slepian multitaper<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
tic<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
nsubj = 4;%numel(subjects);<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
tfreq_Low  = cell(1,nsubj);<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
tfreq_High  = cell(1,nsubj);<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
for i=1:nsubj<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    % load the erp data<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    datapath = strcat(path_data, '/data')<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    results_path=fullfile(datapath,['Participant_' num2str(subjects{i})]);<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
   <span class="apple-converted-space"> </span></p>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    datafile = fullfile(results_path, ['erp_Cond' num2str(cond) '.mat']);<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    % load the ERP data of subject i from disk<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    load(datafile);<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
   <span class="apple-converted-space"> </span></p>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    erp=eval(['ERP_cond' num2str(cond)]);<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
   <span class="apple-converted-space"> </span></p>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    % Low-frequencies 2-30 Hz<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    cfg              = [];<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    cfg.output       = 'pow';<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    cfg.method       = 'mtmfft';<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    cfg.taper        = 'hanning';<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    cfg.foi          = 2:2:30;                         % analysis 2 to 30 Hz in steps of 2 Hz<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    cfg.t_ftimwin    = ones(length(cfg.foi),1).*0.5;   % length of time window = 0.5 sec<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    cfg.toi          = -1:0.05:1.1;                    % time window "slides" from -1 to 1.1 sec in steps of 0.05 sec (50 ms)<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    tfreq_Low = ft_freqanalysis(cfg, erp);<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
   <span class="apple-converted-space"> </span></p>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
%     % Visualization single plot<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
%     cfg = [];<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
%     cfg.channel      = {'A1'};   <span class="apple-converted-space"> </span><o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
%     figure<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
%     ft_singleplotTFR(cfg, tfreq_Low);<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
   <span class="apple-converted-space"> </span></p>
<p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
  </p>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    % High frequencies 25-100 Hz<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    cfg              = [];<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    cfg.output       = 'pow';<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    cfg.method       = 'mtmconvol';<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    cfg.taper        = 'dpss';<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    cfg.foi          = 25:5:100;                         % analysis 25 to 100 Hz in steps of 5 Hz<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    h  =  ones(length(cfg.foi),1).*20 % vector 1 x numfoi, the amount of spectral smoothing through multi-tapering.<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    % Note that 4 Hz smoothing means plus-minus 4 Hz, i.e. a 8 Hz smoothing box.<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    cfg.t_ftimwin    = ones(length(cfg.foi),1).*0.2;   % length of time window = 0.2 sec FIXED<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    cfg.toi          = -1:0.05:1.1;                  % time window "slides" from -0.1 to 1 sec in steps of 0.01 sec (10 ms)<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    tfreq_High = ft_freqanalysis(cfg, erp);<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    % Visualization single plot<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    cfg = [];<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    cfg.channel      = {'A1'};   <span class="apple-converted-space"> </span><o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    figure<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    ft_singleplotTFR(cfg, tfreq_High);<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    % Visualization single plot<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    cfg = [];<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    cfg.layout = 'C:\Users\Marion\Documents\MATLAB\EEG_AV-Exps\biosemi128.lay';<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
    ft_multiplotTFR(cfg, TFRhann_HF);<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
end<o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<b class=""><span style="color: rgb(47, 85, 151);" class="">Marion VINCENT</span></b><br class="">
Eng., PhD , CNRS Research Engineer<br class="">
<b class="">Tel</b>: +33 607 59 46 76<br class="">
<br class="">
Laboratoire SCALab UMR CNRS 9193<br class="">
Université Lille 3<br class="">
BP 60149<br class="">
59653 Villeneuve d'Ascq Cedex<br class="">
<i class=""><a href="http://scalab.cnrs.fr/" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class="">http://scalab.cnrs.fr</a></i><br class="">
--------------------------------------------<br class="">
L’Imaginarium / SCV-IrDIVE Equipex<br class="">
99a Boulevard Descat<br class="">
59200 Tourcoing<br class="">
<i class=""><a href="http://www.irdive.fr/" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class="">http://www.irdive.fr</a></i><a href="http://www.irdive.fr/" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class="">/</a><o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
 <o:p class=""></o:p></div>
</div>
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="font-size: 10.5pt; font-family: Helvetica, sans-serif;" class="">_______________________________________________<br class="">
fieldtrip mailing list<br class="">
</span><a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class=""><span style="font-size: 10.5pt; font-family: Helvetica, sans-serif;" class="">https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</span></a><span style="font-size: 10.5pt; font-family: Helvetica, sans-serif;" class=""><br class="">
</span><a href="https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline;" class=""><span style="font-size: 10.5pt; font-family: Helvetica, sans-serif;" class="">https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202</span></a><o:p class=""></o:p></div>
</div>
</blockquote>
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<o:p class=""> </o:p></div>
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<p class="MsoNormal" style="margin: 0cm 0cm 12pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;">
<o:p class=""> </o:p></p>
<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div class="">
<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<span style="" class=""><o:p class=""> </o:p></span></div>
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<div style="margin: 0cm 0cm 0.0001pt; font-size: 11pt; font-family: Calibri, sans-serif;" class="">
<o:p class=""> </o:p></div>
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<o:p class=""> </o:p></div>
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<span style="font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">_______________________________________________</span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">fieldtrip
 mailing list</span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline; font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br style="font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<a href="https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202" style="color: rgb(149, 79, 114); text-decoration: underline; font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-size-adjust: auto; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202</a><br style="font-family: Helvetica; font-size: 14px; font-style: normal; font-variant-caps: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
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</blockquote>
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<br class="">
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