<div dir="ltr"><div dir="ltr">Dear FieldTrip community,<div><br></div><div>I have a 2 x 2 mixed study design (within factor being pre post, and between factor being group 1 and group 2) in which I am hoping to use an ANOVA in the cluster based permutation framework to analyze.</div><div><br></div><div>Since I have a 2 x 2 factorial design, I have been following the tutorial: </div><div><br></div><div><a href="http://www.fieldtriptoolbox.org/faq/how_can_i_test_an_interaction_effect_using_cluster-based_permutation_tests">http://www.fieldtriptoolbox.org/faq/how_can_i_test_an_interaction_effect_using_cluster-based_permutation_tests</a><br></div><div><br></div><div>as well as various previous responses on the mailing list.</div><div><br></div><div>In the context that I have an interaction in certain electrodes at certain time points, my questions are:</div><div><br></div><div>1. How would I go about testing the simple effects to disentangle the interaction. Would it simply be a case of skipping the main effects and running the appropriate indep/dep t-test between each 4 of the possible contrasts for simple effects? (i.e. group 1 vs group 2 at pre, group 1 vs group 2 at post, group 1 at pre vs group 1 at post, group 2 at pre vs group 2 at post). </div><div><br></div><div>2). If an interaction is initially found, should the post-hoc (e.g. simple main effects) be limited to the electrodes and time in which the interactions are present, or would the simple effect contrasts be run across all electrodes and time points as were run in the initial interaction test.</div><div><br></div><div>Any insight would be greatly appreciated.</div><div><br></div><div>Thank you,</div><div>Paul</div><div></div></div></div>