<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>
</head>
<body dir="ltr">
<div id="divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-size:12pt; color:rgb(0,0,0); font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols">
<p style="margin-top:0; margin-bottom:0"><span id="ms-rterangepaste-start"></span></p>
<p style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">
Dear Fieldtrippers</p>
<p style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">
<br>
</p>
<p style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">
I've been scouring the FT documentation and mailing list but can't seem to find the answer to a fairly simple question (which seems to have remained unanswered previously <a href="https://mailman.science.ru.nl/pipermail/fieldtrip/2016-August/010816.html" target="_blank" rel="noopener noreferrer" class="x_OWAAutoLink" id="LPlnk820311" previewremoved="true">https://mailman.science.ru.nl/pipermail/fieldtrip/2016-August/010816.html</a>):
 how does one know the size/'radius' of the individual source gridpoints modeled by Fieldtrip? </p>
<p style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">
<br>
</p>
<p style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">
I've been warping MNI template source models (with RO selected from a functional atlas of ~300 regions) to individual subject MRI headmodels to extract source timeseries via LCMV beamformer. In ft_prepare_sourcemodel there are seemingly options to control the
 *spacing* between gridpoints in a whole-brain source grid (cfg.grid.resolution), but nothing to control how large the individual sources are (either for whole-brain grids, or a priori cfg.grid.pos values that I've been using). </p>
<p style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">
<br>
</p>
<p style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">
Does this mean that the size of individual gridpoints cannot be changed within ft_prepare_sourcemodel? Are they also in absolute terms fairly small (e.g. ~1mm)? If so, is the only way to extract 'larger' sources to fit a whole-brain grid (e.g. using the 4mm-spaced
 source template provided by FT), identify gridpoints after ft_sourceanalysis that fall within a specified Euclidean distance (e.g. 5mm) of the functional atlas MNI coordinates, and then e.g. average over all those gridpoints? I'm concerned that larger source
 gridpoints might have larger SNR...</p>
<p style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">
<br>
</p>
<p style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">
Thanks in advance!</p>
<p style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">
Ravi</p>
<p style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">
<br>
</p>
<p style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">
</p>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">
--</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">
Ravi Mill, PhD</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">
Post-doctoral researcher</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">
Center for Molecular and Behavioral Neuroscience (CMBN)</div>
<div style="font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif,Helvetica,EmojiFont,"Apple Color Emoji","Segoe UI Emoji",NotoColorEmoji,"Segoe UI Symbol","Android Emoji",EmojiSymbols; font-size:16px">
Rutgers University</div>
<span id="ms-rterangepaste-end"></span><br>
<p></p>
</div>
</body>
</html>