<div dir="ltr">Hi Elena,<div>I had the same issue when I use the sour interpolation function in Fieldtrip.  This is what I did: outsource.pos(:,1) = outsource.pos(:,1)*-1; My images are in the SPM system with the AC's coordinates being [0 0 0] and the sagittal (X) coordinate of the PC being 0 too. </div><div>However, it seems that the ft_sourceinterpolate flips my source images occasionally (not for all the data). I did not spend too much time on it, so I still have no idea why the function does that.</div><div><br></div><div>Best,</div><div>Wanze</div><div><br></div><div> </div><div><br></div><div><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">2018-06-21 9:17 GMT-04:00 Elena Krugliakova <span dir="ltr"><<a href="mailto:krugliakova.es@gmail.com" target="_blank">krugliakova.es@gmail.com</a>></span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div>Dear Jan-Mathijs,<br><br></div>Thank you for your answer, it helped! <br><br></div>But additionally I needed to interpolate atlas on the resliced mri, otherwise ft_sourceparcellate gave me an error "<i>the source positions are not consistent with the parcellation</i>".<br><div><div><br></div><div>Best, <br></div><div>Elena<br></div></div></div><div class="HOEnZb"><div class="h5"><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On 21 June 2018 at 11:43, Schoffelen, J.M. (Jan Mathijs) <span dir="ltr"><<a href="mailto:jan.schoffelen@donders.ru.nl" target="_blank">jan.schoffelen@donders.ru.nl</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">



<div style="word-wrap:break-word">
Hi Elena,
<div><br>
</div>
<div>I guess that any graphics editing program (like adobe illustrator, or even windows paint) can flip the figure for you. :)</div>
<div>If you want to do this prior to generating the figure, you can cal ft_volumereslice on your anatomical image. Provided the coordinate system attached to the volume is right handed, right will be right and left will be left, after reslicing.</div>
<div><br>
</div>
<div>Best wishes,</div>
<div>Jan-Mathijs</div>
<div><br>
</div>
<div>
<blockquote type="cite"><div><div class="m_-7195150249717412280h5">
<div>On 21 Jun 2018, at 11:23, Elena Krugliakova <<a href="mailto:krugliakova.es@gmail.com" target="_blank">krugliakova.es@gmail.com</a>> wrote:</div>
<br class="m_-7195150249717412280m_3308604851992510445Apple-interchange-newline">
</div></div><div><div><div class="m_-7195150249717412280h5">
<div dir="ltr">
<div>
<div>
<div>
<div>
<div>Dear FieldTrip users,<br>
<br>
</div>
I am trying to plot my source localisation results on parcelled brain following this tutorial:<br>
<a href="http://www.fieldtriptoolbox.org/tutorial/salzburg#plot_the_result_in_parceled_brain_space" target="_blank">http://www.fieldtriptoolbox.or<wbr>g/tutorial/salzburg#plot_the_<wbr>result_in_parceled_brain_space</a><br>
<br>
</div>
Similarly to the figure in tutorial I get plot with inverted left-right axis (left appears on the right and right on the left). I guess this is related to the transformation matrix of<i><b> template_mri</b></i> that is used for interpolation
 of source and atlas.<br>
<br>
</div>
Is there some way to flip left and right on the sourceplot? <br>
<br>
</div>
Thanks!<br>
<br>
</div>
Elena<br>
<div>
<div>
<div><br>
 </div>
</div>
</div>
</div></div></div>
______________________________<wbr>_________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">https://mailman.science.ru.nl/<wbr>mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
<a href="https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202" target="_blank">https://doi.org/10.1371/journa<wbr>l.pcbi.1002202</a></div>
</blockquote>
</div>
<br>
</div>

<br>______________________________<wbr>_________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" rel="noreferrer" target="_blank">https://mailman.science.ru.nl/<wbr>mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
<a href="https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202" rel="noreferrer" target="_blank">https://doi.org/10.1371/journa<wbr>l.pcbi.1002202</a><br></blockquote></div><br></div>
</div></div><br>______________________________<wbr>_________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" rel="noreferrer" target="_blank">https://mailman.science.ru.nl/<wbr>mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
<a href="https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002202" rel="noreferrer" target="_blank">https://doi.org/10.1371/<wbr>journal.pcbi.1002202</a><br></blockquote></div><br></div>