<div dir="ltr">I am using Fieldtrip to conduct time frequency analyses  on an EEG dataset that has 2 factors each with multiple levels. I would like be able to display the data within a factor/level relative to a baseline computed using the average over levels and factors.<div>Currently, 

<span style="color:rgb(34,34,34);font-family:arial,sans-serif;font-size:small;font-style:normal;font-variant-ligatures:normal;font-variant-caps:normal;font-weight:400;letter-spacing:normal;text-align:start;text-indent:0px;text-transform:none;white-space:normal;word-spacing:0px;background-color:rgb(255,255,255);text-decoration-style:initial;text-decoration-color:initial;float:none;display:inline">to plot relative to the condition/level specific baseline I am using.</span></div><div>                cfg = [];</div><div>                cfg.baseline     = [-0.5  0.5];</div><div>                cfg.baselinetype = 'relative';</div><div>                cfg.zlim         = 'maxmin';</div><div>                cfg.ylim         = [8 12];</div><div>                cfg.layout   = 'acticap-64ch-standard2.mat';</div><div>                cfg.xlim = [-0.5:0.05:.5];</div><div>                cfg.comment = 'xlim';</div><div>                cfg.commentpos = 'title';</div><div>                f1 = figure;</div><div>                ft_topoplotTFR(cfg, GABDCLRtfr)</div><div> Reading through the documentation I do not see any way to specify a baseline from a different TFR. </div><div>Have I missed something or is it necessary to compute the baseline normalization directly and then plot as absolute data? </div><div><br></div><div>Thanks,</div><div>--Ed Auer</div></div>