<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif;font-size:small;color:rgb(0,0,0)">Hi all,</div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif;font-size:small;color:rgb(0,0,0)"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif;font-size:small;color:rgb(0,0,0)">I'm starting with EEG analysis and Fiedltrip, and I'll would like to plot topographical maps of the connectivity (using imaginary part of coherence).  I tried ft_topoplotCC to make a connection line/arrow graph, but I think I'm doing something wrong because the graph at 10 hz seems to be the same at 50 hz (attached some images). In addition, I was wondering if there is any way to set a threshold, so only fewer lines are plotted in the connection map.  Below the code I'm using in matlab.<br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif;font-size:small;color:rgb(0,0,0)"></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif;font-size:small;color:rgb(0,0,0)"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif;font-size:small;color:rgb(0,0,0)">%CODE<br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif;font-size:small;color:rgb(0,0,0)">    %calculate coherence<br>    cfg = [];<br>    cfg.method = 'mtmfft';<br>    cfg.taper  = 'hanning';<br>    %connectivity analysis needs power and phase -> 'pownadcsd'<br>    cfg.output = 'powandcsd';<br>    % windows of frequency of interest foilim<br>    cfg.foilim = [1 60];<br>    freq1 = ft_freqanalysis(cfg, data);<br>    <br>    %calculating the imaginary part of the coherence<br>    cfg = [];<br>    cfg.method = 'coh';<br>    cfg.complex = 'absimag';<br>    conn1 = ft_connectivityanalysis(cfg, freq1);<br>    <br>    %The conectome<br>    %figure;imagesc(conn1.cohspctrm);<br>    <br>    cfg = [];</div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif;font-size:small;color:rgb(0,0,0)">    %my layout<br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif;font-size:small;color:rgb(0,0,0)">    cfg.layout = layout;<br>    cfg.foi = 10;<br>    ft_topoplotCC(cfg, conn1)<br>    <br>    cfg = [];<br>    cfg.layout = layout;<br>    cfg.foi = 50;<br>    ft_topoplotCC(cfg, conn1)<br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif;font-size:small;color:rgb(0,0,0)"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif;font-size:small;color:rgb(0,0,0)"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:tahoma,sans-serif;font-size:small;color:rgb(0,0,0)"><br clear="all"></div><div><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><p style="margin:0cm 0cm 0.0001pt"><span style="font-size:9pt">Best
regards / Cordiales saludos</span></p>

<p style="margin:0cm 0cm 0.0001pt"><span style="font-size:12px">Christian <br></span></p><p style="margin:0cm 0cm 0.0001pt"><span style="font-size:12px"><br></span></p></div></div></div></div></div>
</div>