<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 14 (filtered medium)">
<style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Tahoma;
        panose-1:2 11 6 4 3 5 4 4 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:12.0pt;
        font-family:"Times New Roman","serif";}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:purple;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-reply;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:#1F497D;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-size:10.0pt;}
@page WordSection1
        {size:612.0pt 792.0pt;
        margin:72.0pt 72.0pt 72.0pt 72.0pt;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]-->
</head>
<body lang="EN-GB" link="blue" vlink="purple">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Dear Sabrina,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">This code works for me on the interpolated volume:<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-family:"Courier New""><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:black">cfg = [];</span><span style="font-family:"Courier New""><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:black">cfg.parameter =
</span><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:#A020F0">'stat'</span><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:black">;</span><span style="font-family:"Courier New""><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:black">cfg.filename =
</span><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:#A020F0">'stat_interp'</span><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:black">;</span><span style="font-family:"Courier New""><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:black">cfg.datatype =
</span><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:#A020F0">'float'</span><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:black">;</span><span style="font-family:"Courier New""><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:black">cfg.filetype =
</span><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:#A020F0">'nifti'</span><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:black">;</span><span style="font-family:"Courier New""><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:black">cfg.vmpversion    = 2;</span><span style="font-family:"Courier New""><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:black">cfg.coordsys      =
</span><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:#A020F0">'spm'</span><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:black">;</span><span style="font-family:"Courier New""><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span style="font-size:10.0pt;font-family:"Courier New";color:black">ft_volumewrite(cfg, sourceint);</span><span style="font-family:"Courier New""><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">I use this to plot ‘blobs’ outside of fieldtrip.<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">best,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D">Sebastian<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:11.0pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:#1F497D"><o:p> </o:p></span></p>
<div>
<div style="border:none;border-top:solid #B5C4DF 1.0pt;padding:3.0pt 0cm 0cm 0cm">
<p class="MsoNormal"><b><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif"">From:</span></b><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:"Tahoma","sans-serif""> fieldtrip-bounces@science.ru.nl [mailto:fieldtrip-bounces@science.ru.nl]
<b>On Behalf Of </b>s.chettouf@vu.nl<br>
<b>Sent:</b> 08 November 2017 10:15<br>
<b>To:</b> FieldTrip discussion list<br>
<b>Subject:</b> [FieldTrip] Convert fieldtrip beamformers to SPM<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:black">Dear fieldtrip community,<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:black"><o:p> </o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:black">I analysed my EEG data in fieldtrip and calculated beamformers. I would like to compare these source data with my fMRI sources and therefore do both statistical
 testings in SPM. But how can I export my beamformer data to SPM? Converting them with spm_ eeg _ ft2spm does not work with beamformer data.<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:black">I also tried ft_volumewrite to convert the beamformer results to nifti, but without succes. <o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:black"><o:p> </o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:black">Thanks in advance,<o:p></o:p></span></p>
</div>
<div>
<p class="MsoNormal"><span style="font-size:10.5pt;font-family:"Calibri","sans-serif";color:black">Sabrina<o:p></o:p></span></p>
</div>
</div>
</body>
</html>