<div dir="ltr"><div><div>Dear Community,<br><br></div>My name is Chuanji Gao, I'm a PhD student in Experimental Psychology Program<br></div><div>at University of South Carolina. I'm now analyzing EEG data to get some event-related<br></div><div>fields results.<br></div><br><div><div><div><div>There are three conditions (condition1, 2 and 3) that I want to compare. So I used<br></div><div>ft_timelockstatistics to run the cluster-based permutation test firstly. The cfg are as below.<br><br>%---------<br><i>cfg = [];<br>...<br>cfg.neighbours  = neighbours;<br>...<br></i></div><div><i>cfg.latency     = <span style="color:rgb(0,255,0)">[0.1 0.8];</span><br>cfg.avgovertime = <span style="color:rgb(0,255,0)">'no';</span><br>cfg.parameter   = 'avg';<br>cfg.method      = 'montecarlo';<br>cfg.statistic   = 'depsamplesFmultivariate'; <br></i></div><div><i>...<br>Nsub = 19;<br>cfg.design(1,1:3*Nsub)  = [ones(1,Nsub) 2*ones(1,Nsub) 3*ones(1,Nsub)]; <br>cfg.design(2,1:3*Nsub)  = [1:Nsub 1:Nsub 1:Nsub];<br>cfg.ivar                = 1; <br>cfg.uvar                = 2; <br>stat = ft_timelockstatistics(cfg,<span style="color:rgb(0,255,0)">cond1{:},cond2{:}, cond3{:});</span></i><br>%---------<br></div><div>The null hypothesis was rejected, and it seems the effect was most pronounced<br></div><div>from 224ms to 800ms at centro-parietal regions.<br><br></div><div>The next step: I want to do pairwise comparisons of the three conditions.<br>I'm not sure if I should use the time window identified from the last analyses as below:<br><i>...<br>cfg.latency     =<span style="color:rgb(255,0,0)"> [0.224 0.8];</span><br>cfg.avgovertime = <span style="color:rgb(255,0,0)">'yes';</span><br>cfg.parameter   = 'avg';<br>cfg.method      = 'montecarlo';<br>cfg.statistic   = 'ft_statfun_depsamplesT'; <br></i></div><div><i>...<br>stat = ft_timelockstatistics(cfg,<span style="color:rgb(255,0,0)">cond1{:},cond2{:});</span></i><br><br></div><div>OR should I use the whole time window as I used in the first analyses as below:<br><i>...<br>cfg.latency     =<span style="color:rgb(255,0,0)"> [0.1 0.8];</span><br>cfg.avgovertime = '<span style="color:rgb(255,0,0)">no';</span><br>cfg.parameter   = 'avg';<br>cfg.method      = 'montecarlo';<br>cfg.statistic   = 'ft_statfun_depsamplesT'; <br>...<br>stat = ft_timelockstatistics(cfg,<span style="color:rgb(255,0,0)">cond1{:},cond2{:});</span></i><br><br></div><div>I'm inclined to use the whole time window and "non-average over time", but not<br></div><div>entirely sure. Can someone give me some suggestions on it? Any help would be<br></div><div>very appreciated. <br></div><div><br></div><div>Best,<br></div><div>Chuanji<br clear="all"></div><div><div><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">Chuanji Gao<br></div><div>PhD student<br></div><div dir="ltr"><div>Department of Psychology</div><div>University of South Carolina</div><div><br></div><div>E-Mail <a href="mailto:chuanji@email.sc.edu" target="_blank">chuanji@email.sc.edu</a></div></div></div></div></div></div>
</div></div></div></div></div>