<div dir="auto">Hey Michał,<div dir="auto"><br></div><div dir="auto">by default it clusters effects that are adjacent (in time, space, frequency - depending on your search space) above some treshold. The adjacency in space is defined by adjacency matrix (or more precisely cfg.neighbours structure).</div><div dir="auto">Take a look at fieldtrip tutorials about nonparametric cluster-based permitation tests - there should be a reference to the Maris, Oostenveld 2007 paper too.</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">28.02.2017 11:47 AM "Michał Komorowski" <<a href="mailto:michak@is.umk.pl">michak@is.umk.pl</a>> napisał(a):<br type="attribution"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hey,<div><br></div><div>Not exactly.</div><div>Function 'clusterstat' takes advantage of 'spm_bwlabel' function to clusterize data, then it computes a cluster-level statistic. <br><br>I want to know what algorithm is used: k-means? DBSCAN? Other ?</div><div><br></div><div>Thank you for your fast reply.<br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">2017-02-28 11:13 GMT+01:00 Maité Crespo García <span dir="ltr"><<a href="mailto:maity_winky@yahoo.es" target="_blank">maity_winky@yahoo.es</a>></span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div style="color:#000;background-color:#fff;font-family:HelveticaNeue,Helvetica Neue,Helvetica,Arial,Lucida Grande,sans-serif;font-size:14px"><div id="m_6825594974671602253m_-3739839433296091211yiv1663887751"><div id="m_6825594974671602253m_-3739839433296091211yui_3_16_0_ym19_1_1488275236492_10104"><div style="color:#000;background-color:#fff;font-family:HelveticaNeue,Helvetica Neue,Helvetica,Arial,Lucida Grande,sans-serif;font-size:14px" id="m_6825594974671602253m_-3739839433296091211yui_3_16_0_ym19_1_1488275236492_10103"><div id="m_6825594974671602253m_-3739839433296091211yui_3_16_0_ym19_1_1488275236492_10105">Hi Michal,</div><div id="m_6825594974671602253m_-3739839433296091211yui_3_16_0_ym19_1_1488275236492_10230"><br clear="none"></div><div id="m_6825594974671602253m_-3739839433296091211yui_3_16_0_ym19_1_1488275236492_10231"><div dir="ltr" id="m_6825594974671602253m_-3739839433296091211yui_3_16_0_ym19_1_1488275236492_12002">The 'ft_statistics_montecarlo' uses as default the maxsum statistic and the algorithms for clustering are in the 'clusterstat' function, inside the private folder. Is that what you mean?</div><div dir="ltr" id="m_6825594974671602253m_-3739839433296091211yui_3_16_0_ym19_1_1488275236492_12186"><br></div><div dir="ltr" id="m_6825594974671602253m_-3739839433296091211yui_3_16_0_ym19_1_1488275236492_12187">Best wishes,</div><div dir="ltr" id="m_6825594974671602253m_-3739839433296091211yui_3_16_0_ym19_1_1488275236492_12188">Maité<br></div></div><div><span></span></div> <div class="m_6825594974671602253m_-3739839433296091211yiv1663887751qtdSeparateBR" id="m_6825594974671602253m_-3739839433296091211yui_3_16_0_ym19_1_1488275236492_10102"><br clear="none"><br clear="none"></div></div></div></div><div class="m_6825594974671602253m_-3739839433296091211.yiv1663887751yahoo_quoted"> <div style="font-family:HelveticaNeue,Helvetica Neue,Helvetica,Arial,Lucida Grande,sans-serif;font-size:14px"> <div style="font-family:HelveticaNeue,Helvetica Neue,Helvetica,Arial,Lucida Grande,sans-serif;font-size:16px"><div><div class="m_6825594974671602253h5"> <div dir="ltr"><font size="2" face="Arial"> El Martes 28 de febrero de 2017 1:40, Michał Komorowski <<a href="mailto:michak@is.umk.pl" target="_blank">michak@is.umk.pl</a>> escribió:<br clear="none"></font></div>  <br clear="none"><br clear="none"> </div></div><div class="m_6825594974671602253m_-3739839433296091211yiv1663887751y_msg_container"><div><div class="m_6825594974671602253h5"><div class="m_6825594974671602253m_-3739839433296091211qtdSeparateBR"><br><br></div><div class="m_6825594974671602253m_-3739839433296091211yiv1663887751yqt4207782871" id="m_6825594974671602253m_-3739839433296091211yiv1663887751yqt92722"><div id="m_6825594974671602253m_-3739839433296091211yiv1663887751"><div dir="ltr">Dear Fieldtrippers,<div><br clear="none"></div><div>Does anybody know what clustering algorithm is used in ft_statistics_montecarlo (ft_sourcestatistics with <span>cfg.correctm = 'cluster')</span> when analysing data from ft_sourceanalysis?<br clear="none"><br clear="none">It seems like spm_bwlabel function is used, but I have not found an open source.</div><div><br clear="none"></div><div>Any help would be greatly appreciated.<br clear="all"><div><br clear="none"></div>-- <br clear="none"><div class="m_6825594974671602253m_-3739839433296091211yiv1663887751gmail-m_-2081932943787640327gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><span style="font-size:12.8px">Michał Komorowski, MSc</span><div><font size="1">Nicolaus Copernicus University in Toruń</font></div><div><span style="font-size:x-small">Faculty of Physics, Astronomy and Informatics</span><font size="1"><br clear="none"></font></div><div><font size="1">Department of Informatics</font></div></div></div></div></div></div></div>
</div></div></div></div><br clear="none"></div></div>______________________________<wbr>_________________<br clear="none">fieldtrip mailing list<br clear="none"><a rel="nofollow" shape="rect" href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" target="_blank">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br clear="none"><a rel="nofollow" shape="rect" href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">https://mailman.science.ru.nl/<wbr>mailman/listinfo/fieldtrip</a><br clear="none"><br clear="none"></div>  </div> </div>  </div></div></div><br>______________________________<wbr>_________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" target="_blank">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" rel="noreferrer" target="_blank">https://mailman.science.ru.nl/<wbr>mailman/listinfo/fieldtrip</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="m_6825594974671602253gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><span style="font-size:12.8px">Michał Komorowski, MSc</span><div><font size="1">Nicolaus Copernicus University in Toruń</font></div><div><span style="font-size:x-small">Faculty of Physics, Astronomy and Informatics</span><font size="1"><br></font></div><div><font size="1">Department of Informatics</font></div></div></div></div></div></div></div>
</div>
<br>______________________________<wbr>_________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" rel="noreferrer" target="_blank">https://mailman.science.ru.nl/<wbr>mailman/listinfo/fieldtrip</a><br></blockquote></div></div>

<br>
<hr>