<div dir="ltr">Dear FieldTrip users,<div><br></div><div>I have a rather general question regarding cluster-based permutation test.</div><div><br></div><div>In the tutorial for Cluster-based permutation tests on event related fields, I read that sensitivity of the analysis depends on the length of the time interval that is analyzed. Elsewhere, I found a similar reasoning regarding channels, in the sense that it the exclusion of the sensors where no effect is likely to be present should yield a more sensitive analysis.</div><div><br></div><div>In my experiment, I analyzed a limited set of central electrodes (where previous evidence suggests that the difference should be located) and found a significant positive cluster, and a (smaller) significant negative one. When doing the same analysis considering all the electrodes, no significant negative cluster is found, just a positive one. Among other things, this may reflect a different sensitivity as a function of the number of channels considered in the analysis. I explored a bit the different parameters (such as neighbors channels definition), but I did not identify the source of the difference between the analyses.</div><div><br></div><div>Leaving aside my specific case, in more general terms I cannot understand how sensitivity is increased by focusing on a smaller time-windows, or on a specific set of electrodes. After all, the number of comparisons we make should not affect the number of samples surpassing the threshold, nor the clustering as a function of the spatial and temporal adjacency of these supra-theshold samples. I understand that the same cluster may vary when other samples are considered in the analyses (for example, samples from other electrodes may get included), but again, I am failing to see how this may be related to the sensitivity of the analysis. The cluster-level statistics, for example, should not be weakened by this.</div><div><br></div><div>I apologize if this message underlies any gross misunderstanding. </div><div><br></div><div>Michele Scaltritti</div></div>