<div dir="ltr"><div>Suzanne,</div><div>I think it may be a simple error in the way you formatted the inputs to that command.  According to the help comments at the beginning of the function:</div><div><br></div><div>% Use as</div><div>%  [spike] = ft_read_spike(filename, ...)</div><div>%</div><div>% Additional options should be specified in key-value pairs and can be</div><div>%   'spikeformat' = string, described the fileformat (default is automatic)</div><div><br></div><div>I don't see any other input arguments being used, so I'm assuming your 1st argument is the filename and guessing your 3rd argument is its location?  If so, the correct format would be:</div><div><br></div><div>>> [rec1] = ft_read_spike('/Users/username/Documents/export/test.nex');</div><div><br></div><div>Including the .nex extension in the filename will allow ft_filetype to automatically detect the format as 'plexon_nex', so you don't need to specify a spikeformat, but if that doesn't work for some reason, I believe the correct formatting (what is meant by key-value pairs) would be:</div><div><br></div><div>>> [rec1] = ft_read_spike('test', 'spikeformat', 'plexon_nex’);</div><div><br></div><div>If neither of those work, I'd be happy to help you troubleshoot this further, as I also use Plexon for data acquisition, have been working on improving FieldTrip's NEX handling, and will be moving into spike analysis soon.  </div><div><br></div><div>Let me know if that helps.</div><div>~Teresa</div><div><br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jan 25, 2017 at 4:55 PM, Suzanne van der Veldt <span dir="ltr"><<a href="mailto:suzannevdveldt@gmail.com" target="_blank">suzannevdveldt@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hello all,<br>
<br>
Sorry to trouble you. I am excited to get starting with using FieldTrip for my data analysis, using in vivo ephys data recorded with plexon. I have my sorted spikes in .nex format. Unfortunately, field trip does not seem to be able to import my data.<br>
<br>
>> [rec1] = ft_read_spike('test', 'plexon_nex', '/Users/username/Documents/<wbr>export’)<br>
Error using ft_read_spike (line 276)<br>
unsupported data format (unknown<br>
<br>
The .nex file is a regular file. I am running Matlab R2015b from Mac OSx Sierra 10.12.2.<br>
<br>
I hope someone might be able to give me a hint of what might be the problem.<br>
<br>
Kind regards,<br>
Suzanne van der Veldt<br>
<br>
PhD student McGill & Université de Bordeaux<br>
______________________________<wbr>_________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" rel="noreferrer" target="_blank">https://mailman.science.ru.nl/<wbr>mailman/listinfo/fieldtrip</a></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><font color="#0000ff" face="garamond, serif"><font size="4">Teresa E. Madsen, PhD<br></font>Division of Behavioral Neuroscience and Psychiatric Disorders<br>Yerkes National Primate Research Center</font><div><font color="#0000ff" face="garamond, serif">Emory University<br></font><div><font color="#0000ff" face="garamond, serif">Rainnie Lab, NSB 5233<br>954 Gatewood Rd. NE<br>Atlanta, GA 30329</font></div><div><font color="#0000ff" face="garamond, serif">(770) 296-9119</font></div></div></div></div>
</div></div>