<div dir="ltr"><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">Dear List<div><br></div><div>I recently got slowed down by a tedious problem regarding the compatibility of world coordinates of volumetric MRI images with different number of voxels.</div><div>Say image1 (in FieldTrip format) contains a /dim/ field of dimensions [256 256 180] and image2 is a resliced version of image1 with dimensions [256 256 256] to make it Freesurfer compatible. Both Image1 and Image2 are defined according to the RAS conventions, although they have different voxel orders in the 3D image box.</div><div><br></div><div>I need to coregister world coordinates (in mm) between the image1 and image2 spaces. However a multiplication of image2 coordinates by the transformation matrices in this form<br></div><div><br></div><div>M = image1.transform/image2.transf<wbr>orm</div><div><br></div><div>would not correctly convert world-coordinate points from the system of reference defined in the space of image2 to the space of image1. I think this is due to the different number of voxels in the two volumes.</div><div><br></div><div><span style="color:rgb(38,50,56);font-size:13px">Did anyone else stumble across this problem before and found a solution ?</span><br></div><div><span style="color:rgb(38,50,56);font-size:13px"><br></span></div><div>Cheers,</div><div>Cris</div><div><br></div><div><br></div></div>
</div><br></div>