<div dir="ltr">Thanks for the answer. I am going to volumelookup the predefined sourcemodel which is provided by HCP, MEG_anatomy_sourcemodel_3d6mm.mat, to the ROI_MNI_V4, as the atlas has the MNI coordination systema and the sourcemodel has the bti coordinations system and there is no transform function in the sourcmodel to convert  bti to mni, what is your suggestion to do so?<div>Thanks</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Sun, Nov 6, 2016 at 1:02 PM Schoffelen, J.M. (Jan Mathijs) <<a href="mailto:jan.schoffelen@donders.ru.nl">jan.schoffelen@donders.ru.nl</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">



<div style="word-wrap:break-word" class="gmail_msg">
ft_convert_coorsys is not accurate. Don’t use it if you want an accurate conversion.
<div class="gmail_msg">Best,</div>
<div class="gmail_msg">Jan-Mathijs</div></div><div style="word-wrap:break-word" class="gmail_msg">
<div class="gmail_msg"><br class="gmail_msg">
<div class="gmail_msg">
<blockquote type="cite" class="gmail_msg">
<div class="gmail_msg">On 06 Nov 2016, at 19:39, mehdy dousty <<a href="mailto:mehdy.dousty@gmail.com" class="gmail_msg" target="_blank">mehdy.dousty@gmail.com</a>> wrote:</div>
<br class="m_247046635766724290Apple-interchange-newline gmail_msg">
<div class="gmail_msg">
<div dir="ltr" class="gmail_msg">Thanks for the answer. how accurate to use ft_convert_coordsys (source, 'spm'), and if it is not, as there is no explanation on wiki unfortunately, how can I make this conversion .
<div class="gmail_msg">Thanks</div>
<div class="gmail_msg">Mehdy</div>
</div>
<br class="gmail_msg">
<div class="gmail_quote gmail_msg">
<div dir="ltr" class="gmail_msg">On Sun, Nov 6, 2016 at 8:22 AM Pelt, S. van (Stan) <<a href="mailto:stan.vanpelt@donders.ru.nl" class="gmail_msg" target="_blank">stan.vanpelt@donders.ru.nl</a>> wrote:<br class="gmail_msg">
</div>
<blockquote class="gmail_quote gmail_msg" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
Hi Mehdy,<br class="gmail_msg">
<br class="gmail_msg">
You should use bti2spm for this. You can find more specific information on this on the HCP wiki website.<br class="gmail_msg">
<br class="gmail_msg">
Hope that helps.<br class="gmail_msg">
<br class="gmail_msg">
Stan<br class="gmail_msg">
<br class="gmail_msg">
> Op 6 nov. 2016, om 00:51 heeft mehdy dousty <<a href="mailto:mehdy.dousty@gmail.com" class="gmail_msg" target="_blank">mehdy.dousty@gmail.com</a>> het volgende geschreven:<br class="gmail_msg">
><br class="gmail_msg">
> Hello all,<br class="gmail_msg">
> The provided head model (MEG_anatomy_sourcemodel_3d6mm.mat) in the HCP (Human connectome project) has a 'BTI' coordination system. As I am going to parcellate the data by an atlas which has a coordination system of "MNI", and could not find any transformation
 between BTI and MNI, I am wondering if anybody knows what are my steps to do so?<br class="gmail_msg">
> Thanks<br class="gmail_msg">
> Mehdy<br class="gmail_msg">
> _______________________________________________<br class="gmail_msg">
> fieldtrip mailing list<br class="gmail_msg">
> <a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" class="gmail_msg" target="_blank">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br class="gmail_msg">
> <a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" rel="noreferrer" class="gmail_msg" target="_blank">
https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br class="gmail_msg">
<br class="gmail_msg">
<br class="gmail_msg">
_______________________________________________<br class="gmail_msg">
fieldtrip mailing list<br class="gmail_msg">
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" class="gmail_msg" target="_blank">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br class="gmail_msg">
<a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" rel="noreferrer" class="gmail_msg" target="_blank">https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br class="gmail_msg">
</blockquote>
</div>
_______________________________________________<br class="gmail_msg">
fieldtrip mailing list<br class="gmail_msg">
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" class="gmail_msg" target="_blank">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br class="gmail_msg">
<a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" class="gmail_msg" target="_blank">https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a></div>
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fieldtrip mailing list<br class="gmail_msg">
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" class="gmail_msg" target="_blank">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br class="gmail_msg">
<a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" rel="noreferrer" class="gmail_msg" target="_blank">https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a></blockquote></div>