<div dir="ltr"><div><div style="font-size:large"><span style="font-size:12.8px">Dear FieldTrip community,</span><br clear="all"></div><div style="font-size:large"><span style="font-size:12.8px"><br></span></div><div><span style="font-size:12.8px">I want to construct a headmodel from the mri data (</span><span style="font-size:12.8px">standard mri providded by fieldTrip). The</span><span style="font-size:12.8px"> dimension of the</span><span style="font-size:12.8px"> </span>mri<span style="font-size:12.8px"> </span><span style="font-size:12.8px">is 181 x 217 X 181</span><span style="font-size:12.8px">The coordinate system of the mri is <b>spm. </b>I want to change to coordinate system to <b>yokogawa</b>. For that purpose, I have used <b>ft_volumerealign </b>function. However, I have to provide at least three fiducial points (nsa, lpa and rpa). I noticed that mri structure itself contains the location of the fiducial points (<b>mri.hdr.fiducial.mri </b>and </span><b style="font-size:12.8px">mri.hdr.fiducial.head</b><span style="font-size:12.8px">). Th fiducial points are like these</span></div><div><span style="font-size:12.8px"><br></span></div><div><span style="font-size:12.8px"><img src="cid:ii_157d6784531aad91" alt="Inline image 1" width="199" height="264" style="margin-right: 0px;"><br></span></div><div><span style="font-size:12.8px">Clearly the lpa coordinate exceeds mri dimension and both nas and rpa coordinates do not indicate these two positions. I am quite confused how I can use the given information about the fiducial points. It would be of great help if anyone could help me in this regards.       </span></div><div><br></div></div><div><br></div><div><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">Thanks and Regards,<div>Susmita Sen</div><div>Research Scholar</div><div>Audio and Bio Signal Processing Lab.</div><div>E & ECE Dept.</div><div>IIT Kharagpur</div></div></div></div></div></div>
</div>