<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
If your sampling rate is 30K, then your time axis should be something like (1:size(data.trial{1},1))./data.fsample; rather than 1:some-number
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
<div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On 12 Aug 2016, at 18:09, Bahareh Elahian (belahian) <<a href="mailto:belahian@memphis.edu" class="">belahian@memphis.edu</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div dir="auto" class="">
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Thanks for suggestions.</div>
<div class="">The data.fsample is 30K. </div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I want to see HFOs in time- frequency plot. <br class="">
Wavelet is one solution of that. </div>
<div class="">The error which I am getting is coming from padding and I do not know where should I fix it. </div>
<div class="">What should I do if I do not want any padding? </div>
<div class=""><br class="">
Bahar</div>
<div class=""><br class="">
On Aug 12, 2016, at 11:04 AM, Schoffelen, J.M. (Jan Mathijs) <<a href="mailto:jan.schoffelen@donders.ru.nl" class="">jan.schoffelen@donders.ru.nl</a>> wrote:<br class="">
<br class="">
</div>
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">It is correct as far as the data.fsample is consistent with this (which I suspect it isn’t).
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">If you are interested in HFO, why not bandpassfilter your data and do a Hilbert transform?</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Best,</div>
<div class="">Jan-Mathijs</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class=""><br class="">
<div class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On 12 Aug 2016, at 17:15, Bahareh Elahian (belahian) <<a href="mailto:belahian@memphis.edu" class="">belahian@memphis.edu</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: 12pt; background-color: rgb(255, 255, 255); font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif;" class="">
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class="">Thanks for the answer,</div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class="">They are the same actually my <span class="">cfg.toi is my <span class="">data.time.</span></span></div>
<div style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;" class="">I specified them the same as each other . was it right?</div>
</div>
<hr tabindex="-1" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; display: inline-block; width: 652.671875px;" class="">
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class=""></span>
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<font face="Calibri, sans-serif" style="font-size: 11pt;" class=""><b class="">From:</b><span class="Apple-converted-space"> </span><a href="mailto:fieldtrip-bounces@science.ru.nl" class="">fieldtrip-bounces@science.ru.nl</a> <<a href="mailto:fieldtrip-bounces@science.ru.nl" class="">fieldtrip-bounces@science.ru.nl</a>>
 on behalf of Schoffelen, J.M. (Jan Mathijs) <<a href="mailto:jan.schoffelen@donders.ru.nl" class="">jan.schoffelen@donders.ru.nl</a>><br class="">
<b class="">Sent:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Friday, August 12, 2016 10:08:20 AM<br class="">
<b class="">To:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>FieldTrip discussion list<br class="">
<b class="">Subject:</b><span class="Apple-converted-space"> </span>Re: [FieldTrip] Wavelet- Time frequency analysis</font>
<div class=""> </div>
</div>
<div style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<div class="">Note that the units of the time points specified in cfg.toi should coincide with the units in the time axis of the data, i.e. data.time.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">JM</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<br class="">
<div class="">
<blockquote type="cite" class="">
<div class="">On 12 Aug 2016, at 16:51, Bahareh Elahian (belahian) <<a href="mailto:belahian@memphis.edu" class="">belahian@memphis.edu</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<div class="">
<div id="divtagdefaultwrapper" class="" style="font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; font-size: 12pt; background-color: rgb(255, 255, 255); font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif;">
<p class="" style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;"></p>
<div class="">Hi All,</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I am trying to apply wavelet on my signal to see HFOs. </div>
<div class="">According to <a href="http://www.fieldtriptoolbox.org/tutorial/timefrequencyanalysis" class="OWAAutoLink" id="LPlnk121702">http://www.fieldtriptoolbox.org/tutorial/timefrequencyanalysis</a> </div>
<div class="">I wrote the following lines but I will get an error that: "<span class="">the padding that you specified is shorter than the data</span>".</div>
<div class="">As far as I understood <span class="" style="font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif, 'Apple Color Emoji', 'Segoe UI Emoji', NotoColorEmoji, 'Segoe UI Symbol', 'Android Emoji', EmojiSymbols; font-size: 16px;">'maxperlen' is the default.</span></div>
<div class="">Any other idea for padding or solving this problem?</div>
<div class="" style="margin-bottom: 20px; overflow: auto; width: 656px; text-indent: 0px;">
<table cellspacing="0" class="" style="width: 590px; position: relative; overflow: auto; padding-top: 20px; padding-bottom: 20px; margin-top: 20px; border-top-width: 1px; border-top-style: dotted; border-top-color: rgb(200, 200, 200); border-bottom-width: 1px; border-bottom-style: dotted; border-bottom-color: rgb(200, 200, 200); background-color: rgb(255, 255, 255);">
<tbody class="">
<tr valign="top" class="" style="border-spacing: 0px;">
<td colspan="1" class="" style="width: 250px; position: relative; display: table-cell; padding-right: 20px;">
<div class="" style="height: 150px; position: relative; margin: auto; display: table; width: 150px; background-color: rgb(255, 255, 255);">
<a href="http://www.fieldtriptoolbox.org/tutorial/timefrequencyanalysis" class="" style="display: table-cell; text-align: center;"><img width="150" height="150" class="" src="https://www.bing.com/th?id=OVP.V249f2fff057aa7a9c87ce8b67ec6c972&pid=Api" style="display: inline-block; max-width: 250px; max-height: 250px; height: 150px; width: 150px; border-width: 0px; vertical-align: bottom;"></a></div>
</td>
<td colspan="2" class="" style="vertical-align: top; position: relative; padding: 0px; display: table-cell;">
<div class=""><a class="ms-Icon--x ms-icon-font-size-14" style="font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-weight: normal; position: relative; cursor: pointer; padding: 8px; float: right; color: rgb(102, 102, 102); -webkit-user-select: none; margin-left: 10px; background-color: rgb(239, 246, 252);"></a></div>
<div class="" style="top: 0px; color: rgb(0, 120, 215); font-weight: normal; font-size: 21px; font-family: wf_segoe-ui_light, 'Segoe UI Light', 'Segoe WP Light', 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; line-height: 21px;">
<a href="http://www.fieldtriptoolbox.org/tutorial/timefrequencyanalysis" class="" style="text-decoration: none;">tutorial:timefrequencyanalysis – FieldTrip</a></div>
<div class="" style="margin: 10px 0px 16px; color: rgb(102, 102, 102); font-weight: normal; font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 14px; line-height: 14px;">
<a href="http://www.fieldtriptoolbox.org/" class="">www.fieldtriptoolbox.org</a></div>
</td>
</tr>
</tbody>
</table>
</div>
<br class="">
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">cfg= [];</div>
<div class="">cfg.pad = 'maxperlen';</div>
<div class="">cfg.method = 'wavelet';</div>
<div class="">cfg.output = 'pow';</div>
<div class="">cfg.channel = 'chan 4';</div>
<div class="">cfg.toi = 1:size(eeg.eeg_data,2);</div>
<div class="">cfg.foilim  = [80 500];</div>
<div class="">[freq] = ft_freqanalysis(cfg, data1);</div>
<br class="">
<p class="" style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;"></p>
<div class="" style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;"><br class="">
</div>
<div class="" style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;"><br class="">
</div>
<div class="" style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;">data1 is  my data which I get by applying ft_preprocessing.</div>
<div class="" style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px;">_________________________________________________</div>
<div class="">
<div class="" style="font-size: 12pt; background-color: rgb(255, 255, 255); font-family: Calibri, Arial, Helvetica, sans-serif;">
<div class="" style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; font-family: Tahoma; font-size: 13px;">
<i class=""><b class="">Bahar</b></i></div>
<div class="" style="margin-top: 0px; margin-bottom: 0px; font-family: Tahoma; font-size: 13px;">
<i class=""></i></div>
</div>
</div>
</div>
<span class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;">_______________________________________________</span><br class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;">
<span class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;">fieldtrip
 mailing list</span><br class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;">
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;">
<a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" class="" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;">https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a></div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">_______________________________________________</span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; float: none; display: inline !important;" class="">fieldtrip
 mailing list</span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">
<a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" style="font-family: Helvetica; font-size: 12px; font-style: normal; font-variant: normal; font-weight: normal; letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px;" class="">https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a></div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
</div>
</blockquote>
<blockquote type="cite" class="">
<div class=""><span class="">_______________________________________________</span><br class="">
<span class="">fieldtrip mailing list</span><br class="">
<span class=""><a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" class="">fieldtrip@donders.ru.nl</a></span><br class="">
<span class=""><a href="https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" class="">https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a></span></div>
</blockquote>
</div>
_______________________________________________<br class="">
fieldtrip mailing list<br class="">
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" class="">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br class="">
https://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</div>
</blockquote>
</div>
<br class="">
</div>
</body>
</html>