
<html>

<head>

<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">

<style type="text/css" style="display:none;"><!-- P {margin-top:0;margin-bottom:0;} --></style>

</head>

<body dir="ltr">

<div id="divtagdefaultwrapper" style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#FFFFFF;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;">

<p>Hello All,</p>

<p><br>

</p>

<p>I'm trying to constrain my source space to gray matter and I found suggestions for how to do this on the FAQ: <a href="http://www.fieldtriptoolbox.org/faq/can_i_restrict_the_source_reconstruction_to_the_grey_matter" class="OWAAutoLink" id="LPlnk291387">http://www.fieldtriptoolbox.org/faq/can_i_restrict_the_source_reconstruction_to_the_grey_matter</a></p>

<div id="LPBorder_GT_14703350641060.6183301699347794" style="margin-bottom: 20px; overflow: auto; width: 100%; text-indent: 0px;">

<table id="LPContainer_14703350640840.18606604333035648" cellspacing="0" style="width: 90%; background-color: rgb(255, 255, 255); position: relative; overflow: auto; padding-top: 20px; padding-bottom: 20px; margin-top: 20px; border-top-width: 1px; border-top-style: dotted; border-top-color: rgb(200, 200, 200); border-bottom-width: 1px; border-bottom-style: dotted; border-bottom-color: rgb(200, 200, 200);">

<tbody>

<tr valign="top" style="border-spacing: 0px;">

<td id="ImageCell_14703350640850.07603367790579796" colspan="1" style="width: 250px; position: relative; display: table-cell; padding-right: 20px;">

<div id="LPImageContainer_14703350641020.07096521276980639" style="background-color: rgb(255, 255, 255); height: 150px; position: relative; margin: auto; display: table; width: 150px;">

<a id="LPImageAnchor_14703350641030.9749991958960891" href="http://www.fieldtriptoolbox.org/faq/can_i_restrict_the_source_reconstruction_to_the_grey_matter" target="_blank" style="display: table-cell; text-align: center;"><img aria-label="Preview image with link selected. Double-tap to open the link." id="LPThumbnailImageID_14703350641030.7211303503718227" style="display: inline-block; max-width: 250px; max-height: 250px; height: 150px; width: 150px; border-width: 0px; vertical-align: bottom;" width="150" height="150" src="http://www.fieldtriptoolbox.org/_media/logo-share.png"></a></div>

</td>

<td id="TextCell_14703350641040.8935965485870838" colspan="2" style="vertical-align: top; position: relative; padding: 0px; display: table-cell;">

<div id="LPRemovePreviewContainer_14703350641040.5319619642104954"></div>

<div id="LPTitle_14703350641040.9797967062331736" style="top: 0px; color: rgb(30, 30, 30); font-weight: normal; font-size: 21px; font-family: wf_segoe-ui_light, 'Segoe UI Light', 'Segoe WP Light', 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; line-height: 21px;">

<a id="LPUrlAnchor_14703350641050.2572534440550953" href="http://www.fieldtriptoolbox.org/faq/can_i_restrict_the_source_reconstruction_to_the_grey_matter" target="_blank" style="text-decoration: none;">faq:can_i_restrict_the_source_reconstruction_to_the_grey

 ...</a></div>

<div id="LPMetadata_14703350641050.9192657605744898" style="margin: 10px 0px 16px; color: rgb(102, 102, 102); font-weight: normal; font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 14px; line-height: 14px;">

www.fieldtriptoolbox.org</div>

<div id="LPDescription_14703350641060.47771703777834773" style="display: block; color: rgb(102, 102, 102); font-weight: normal; font-family: wf_segoe-ui_normal, 'Segoe UI', 'Segoe WP', Tahoma, Arial, sans-serif; font-size: 14px; line-height: 20px; max-height: 100px; overflow: hidden;">

Yes, there are two strategies you can use. You can either make a regular 3D grid spanning the whole brain in which only grid locations in grey matter are considered ...</div>

</td>

</tr>

</tbody>

</table>

</div>

<br>

<p><br>

</p>

<p>The problem is that I cannot figure out how to actually do this. For example, I don't see options in ft_sourceanalysis for inputing segmented mir with the tissue types of interest, now for giving the program an anatomic mask. Any feedback would be greatly

 appreciated.</p>

<p><br>

</p>

<p>Best,</p>

<p><br>

</p>

<p>Alexander</p>

</div>

</body>

</html>