<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">Hello Fieldtrip Community,<br><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">I was analyzing corticocortical (EEG-EEG) and corticomuscular (EEG-sEMG) partial directed coherence with the ft_connectivityanalysis() function and later calculating a frequency dependent threshold for the coherence values in a session using my own implementation of the statistics described in Schelter, Björn, et al. "<b>Testing for directed influences among neural signals using partial directed coherence</b>." <i>Journal of neuroscience methods</i> (2006).  I then considered in my analysis only the significant values higher than this threshold.<br><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">The problem is that now we are applying a more strict preprocessing method that rejects many more trials, leaving us with a <br></div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">​small number of trials ​(sometimes 20 or sometimes even less than 10 trials per session, instead of the 50 or 60 that we had before). This leads us to the problem of the validity of the coherence estimates with few trials and to the problem of the thresholding method, which is based on a theoretical asymptotic limit and gives incorrect results for such a small number of trials.<br><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">So my question is twofold:<br><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">1- What is the minimum number of trials that we are allowed to use, in order to obtain a reasonable estimate for the PDC with ft_connectivityanalysis()<br></div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">2- Do you know of any method for calculating the significance of the coherence values to a given significance level, considering that we have a small number of trials? (permutation tests? something else?)<br><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif">Thank you  </div><div class="gmail_default" style="font-family:trebuchet ms,sans-serif"> <br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div>Thiago da Cruz Figueiredo</div><div><br></div><div>Neuroprosthetics Laboratory, Institute for Medical Psychology and Behavioural Neurobiology - University of Tübingen, Germany<br><br>Núcleo de Inovação Tecnológica em Reabilitação (NITRE) - Universidade Federal da Bahia, Brasil</div></div></div>
</div>