<div dir="ltr">Dear Alex,<div><br></div><div>As far as I know, depsamplesFmultivariate corresponds to what used to be the default option to perform a dependent samples F-test (it was called depsamplesF), which tolerates nonsphericity when there are more than 2 levels by dealing with the question from a multivariate standpoint. But in your case, you can also test main effects and interactions in your 2×2 design, and in that case I think these will yield identical results, and you could as well be using T-tests (comparing averages over the other factor for the main effects, and comparing the differences along one factor at both levels of the other factor for the interaction, see also this <a href="http://www.fieldtriptoolbox.org/faq/how_can_i_test_an_interaction_effect_using_cluster-based_permutation_tests">http://www.fieldtriptoolbox.org/faq/how_can_i_test_an_interaction_effect_using_cluster-based_permutation_tests</a> ). If you would decide to disregard the factor structure of your data and would do something like a one-way ANOVA with 4 levels, I would stick with the MANOVA approach. I would be curious to know whether the univarate version is recommended, apart from the case when one wants results comparable to a conventional ANOVA F-test.</div><div><br></div><div>Greetings,</div><div>Balázs Knakker</div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, May 16, 2016 at 8:55 PM, Alex Sel <span dir="ltr"><<a href="mailto:alex.sel@psy.ox.ac.uk" target="_blank">alex.sel@psy.ox.ac.uk</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-style:solid;border-left-color:rgb(204,204,204);padding-left:1ex">





<div lang="EN-GB" link="#0563C1" vlink="#954F72">
<div>
<p class="MsoNormal">Dear list,<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">I would like to run a non-parametric cluster-based permutation analysis. My experiment has a 2X2 within-subject design, i.e. I would like to compare more than two experimental conditions. I am using the cfg.statistics  = ‘depsamplesFmultivariate’.
 I wonder if this would be the correct option considering that I only have ONE dependent variable (i.e. ANOVA) and not multiple dependent variables (i.e. MANOVA). If this is not the correct statistic, would you be able to tell me what is the correct statistic
 that should be apply to tests differences between more than 2 experimental conditions in a within subject design?<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">Any insight on this would be much appreciated.<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
<p class="MsoNormal">Best wishes,<u></u><u></u></p>
<p class="MsoNormal"><span>Alex Sel, PhD<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>Postdoctoral Researcher<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>Department of Experimental Psychology,<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>University of Oxford,<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>9 South Parks Road,<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>OX1 3UD<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>Tel: 01865 271 340<u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><span>Email: <a href="mailto:Alex.sel@psy.ox.ac.uk" target="_blank">Alex.sel@psy.ox.ac.uk</a><u></u><u></u></span></p>
<p class="MsoNormal"><u></u> <u></u></p>
</div>
</div>

<br>_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" rel="noreferrer" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br></blockquote></div><br></div></div>