<p dir="ltr">Hi Robert, </p>
<p dir="ltr">Thanks for your reply. I am looking to use both, but I have had the same issue with the SPM also. I feel that the problem is not datatype dependent. </p>
<p dir="ltr">Best, </p>
<p dir="ltr">Hassan </p>
<div class="gmail_quote">On Mar 9, 2016 3:39 PM, "Seymour, Robert (Research Student)" <<a href="mailto:seymourr@aston.ac.uk">seymourr@aston.ac.uk</a>> wrote:<br type="attribution"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">




<div dir="ltr">
<div style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#ffffff;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">
<p>Hi Hassan, </p>
<p><br>
</p>
<p>Is there any reason you want to use the FSL template brain? If not, it<span style="font-size:12pt"> might be worth trying SPM template like so: </span></p>
<p><br>
</p>
<p></p>
<pre style="white-space:pre-wrap">[mri]               = ft_read_mri('~pathtofieldtrip/template/anatomy/single_subj_T1');</pre>
<pre style="white-space:pre-wrap">mri.coordsys        ='SPM'</pre>
<br>
<p></p>
<div>Hope this works out for you, </div>
<div><br>
</div>
<div>Rob</div>
</div>
</div>

<br>_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" rel="noreferrer" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br></blockquote></div>