
<html>

  <head>


    <meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=utf-8">

  </head>

  <body bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">

    Hi everyone, <br>

    <br>

    I'm working with clinical MEG data for which part of the source

    pipeline has been conducted by someone else as part of a clinical

    protocol. I don't have full access to what has been done to the MRI

    that I'm getting, so I'm trying to put bits and pieces of code

    together to arrive at a source reconstruction. The rest of my

    pipeline is the pretty standard tutorial beamforming. <br>

    <br>

    I was hoping someone could help me figure out where my source

    analysis is going wrong by looking at this figure. On the left, the

    subject's headmodel seems to be fine (after warping to MNI). On the

    right, I'm plotting the source result without interpolating with any

    structural data. In the middle you see what happens when I

    interpolate the source with the "single_subj_T1.nii" structural

    image.<br>

    It doesn't seem to be a matter of scaling (like mm to cm), but

    rather it being kinda upside down + something else? Does anyone know

    by looking at this whether the error emerges because of an

    unsuccessful interpolation or because something more fundamental is

    going wrong earlier on? <br>

    <br>

    Thanks so much, <br>

    Vitoria<br>

    <br>

    <img src="cid:part1.06080404.05060801@gmail.com" alt="" height="311"

      width="1135"><br>

    <br>

  </body>

</html>