<div dir="ltr">it would be nice if you can post the pics <div>that would give much much info</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Feb 29, 2016 at 4:18 PM,  <span dir="ltr"><<a href="mailto:nwolpert@uni-osnabrueck.de" target="_blank">nwolpert@uni-osnabrueck.de</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Dear fieldtrip users,<br>
<br>
I have an issue when visualizing beamformed data: When using<br>
'ft_sourceplot' to show the interpolated data on slices in the three<br>
planes (cfg.method = 'ortho'), reasonable results are produced. However,<br>
when doing surface plots by calling cfg.method = 'surface', the power is<br>
projected only to a subset of the brain, with very abrupt borders and zero<br>
power everywhere else. It gives the impression that there is some kind of<br>
scaling problem (i.e. the surface template used has the wrong scale), but<br>
I can't figure out the cause for this problem.<br>
<br>
I would be glad if anyone has a possible explanation. I attach the code<br>
below that produced the figures.<br>
<br>
Best,<br>
Nicolai Wolpert<br>
<br>
cfg              = [];<br>
cfg.method       = 'dics';<br>
cfg.grid         = grid;<br>
cfg.headmodel    = headmodel;<br>
cfg.dics.projectnoise = 'yes';<br>
cfg.dics.lambda       = 0;<br>
sourceAlpha_dics = ft_sourceanalysis(cfg, freq_alpha);<br>
<br>
% remove center of head bias by using the neural activity index (NAI)<br>
sourceAlpha_dics.avg.pow = sourceAlpha_dics.avg.pow ./<br>
sourceAlpha_dics.avg.noise;<br>
<br>
% reslice mri<br>
mri_real_resliced = ft_volumereslice([], mri_real);<br>
<br>
% Interpolation: Project computed sources on aligned template MRI brain<br>
cfg            = [];<br>
cfg.downsample = 2;<br>
cfg.parameter = 'avg.pow';<br>
sourceAlpha_dics_intp  = ft_sourceinterpolate(cfg, sourceAlpha_dics ,<br>
mri_real_resliced);<br>
<br>
% visualize the result<br>
cfg              = [];<br>
cfg.method       = 'surface';<br>
cfg.funparameter = 'avg.pow';<br>
ft_sourceplot(cfg, sourceAlpha_dics_intp);<br>
<br>
<br>
_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" rel="noreferrer" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br>
</blockquote></div><br></div>