<div dir="ltr">Dear Fieldtrippers<div><br><div>I am analyzing a .cnt EEG dataset from a Neuroscan amplifier with an hardware bandpass filter of 0.05-200 Hz.</div><div>I am having some troubles with segmentation after performing ICA on continuous the continuous EEG trace.</div><div><br></div><div>Here you find the pipeline I used:</div><div><br></div><div>%% reading the dataset:</div><div>subj = 'C:\data\S01.cnt';<br></div><div><div>cfg = [];<br></div><div>cfg.headerfile =  subj;</div><div>cfg.datafile = subj; </div><div>cfg.continuous = 'yes';</div><div>data_cont = ft_preprocessing(cfg);<br></div><div><br></div></div><div>%% running ICA and cleaning data</div><div>cfg = [];</div><div>cfg.method = 'runica';</div><div>comp = componentanalysis(cfg, data_cont);</div><div><br></div><div><div>cfg = [];<br></div><div>cfg.component = [1:62];</div><div>cfg.layout = 'C:\data\mylayout1010.lay';</div><div>cfg.comment = 'no';</div><div>ft_topoplotIC(cfg, comp);</div><div><br></div><div>cfg          = [];</div><div>cfg.channel  = [1 3 8];</div><div>cfg.viewmode = 'component';</div><div>cfg.layout = 'C:\data\mylayout1010.lay';</div><div>ft_databrowser(cfg, comp);</div></div><div><br></div><div><div>cfg           = [];</div><div>cfg.component = [1 3];</div><div>data_clean    = ft_rejectcomponent(cfg, comp, data_cont);</div></div><div><br></div><div>Now, in order to segment data I did: </div><div><br></div><div>cfg = [];</div><div><div>cfg.continuous = 'no';</div><div>cfg.trailfun = 'ft_trialfun_general';</div><div>cfg.trialdef.eventtype = 'stimtype';</div><div>cfg.trialdef.eventvalue = 8</div><div>cfg.trialdef.prestim = 1;<br></div><div>cfg.trialdef.poststim = 4;</div><div>cfg = ft_definetrial(data_clean);<br></div><div>segmented = ft_preprocessing(cfg, data_clean);</div></div><div><br></div><div>but, the Command Window retured me with the following error:</div><div><br></div><div><div><font color="#ff0000">Reference to non-existent field 'headerfile'.</font></div><div><span style="background-color:rgb(238,238,238)"><font color="#ff0000"><br></font></span></div><div><font color="#ff0000" style="background-color:rgb(243,243,243)">Error in ft_trialfun_general (line 78)</font></div><div><font color="#ff0000" style="background-color:rgb(243,243,243)">hdr = ft_read_header(cfg.headerfile, 'headerformat', cfg.headerformat);</font></div><div><font color="#ff0000" style="background-color:rgb(243,243,243)"><br></font></div><div><font color="#ff0000" style="background-color:rgb(243,243,243)">Error in ft_definetrial (line 174)</font></div><div><font color="#ff0000" style="background-color:rgb(243,243,243)">    [trl, event] = feval(cfg.trialfun, cfg);</font></div></div><div><font color="#ff0000" style="background-color:rgb(243,243,243)"><br></font></div><div><font color="#ff0000" style="background-color:rgb(243,243,243)"><br></font></div><div>I cannot get why both the headerfile and the dataset file are needed to be specified again.</div><div>Could someone help me to figure it out?<br></div><div><br></div><div>Many thanks in advance,</div><div><br></div><div><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><font face="tahoma, sans-serif" size="2">Giuseppe Spinelli</font></div><div dir="ltr"><font size="1" face="tahoma, sans-serif"><br></font></div><div dir="ltr"><font size="1" face="tahoma, sans-serif">Ph.D. student in Cognitive Social and Affective Neuroscience</font></div><div dir="ltr"><div><div><font size="1" face="tahoma, sans-serif"><br></font></div><div><font size="1" face="tahoma, sans-serif">Department of Psychology, Sapienza University of Rome<br></font></div><div><font size="1" face="tahoma, sans-serif">via dei Marsi 78, 00185 - Rome</font></div><div><font size="1" face="tahoma, sans-serif">Phone/Fax: +39 06-49917635 </font></div><div><font size="1" face="tahoma, sans-serif"><br></font></div><div><div><font size="1" face="tahoma, sans-serif">IRCCS Fondazione Santa Lucia</font></div><div><font size="1" face="tahoma, sans-serif">via Ardeatina 306, 00179 - Rome</font></div><div><font size="1" face="tahoma, sans-serif">Phone: +39 06 5150 1108</font></div></div><div><font size="1" face="tahoma, sans-serif"><br></font></div><div><font size="1" face="tahoma, sans-serif">@: <a href="mailto:giuseppe.spinelli@uniroma1.it" target="_blank">giuseppe.spinelli@uniroma1.it</a><br></font></div></div><div><a href="http://agliotilab.org/" target="_blank"><font size="1" face="tahoma, sans-serif">http://agliotilab.org/</font></a></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</div></div></div>