<html>

<head>

<style><!--

.hmmessage P

{

margin:0px;

padding:0px

}

body.hmmessage

{

font-size: 12pt;

font-family:Calibri

}

--></style></head>

<body class='hmmessage'><div dir='ltr'>Dear Eric,<br>dear other experts,<br><br>We conduct a

 study that involves corticomuscular coherence analyses and I am still a bit new to the field.<br>Even though I

 read several papers and searched the fieldtrip mailing list, I am still

 not sure how to do the statistical testing correctly. I read your 

message "coherence and group analysis" from April 21 2015 with great 

interest and I was hoping you could maybe give me some advice.<br>There are two groups and each group has the same condition (a motor movement task).<br>I

 have the coherence spectra for the range 5-55Hz (binned at 0.3Hz) of an

 EEG signal x and an EMG signal y  in 24 healthy controls and 19 

patients and I would like to test if there is a significant difference 

between the two groups. The coherence of the individual subjects was 

computed from around 120 segments of each 3s. Specifically I have the following questions: 1.

 Can I use the fieldtrip function ft_freqstatistics to calculate 

Monte-Carlo estimates of the significance probabilities and setting 

cfg.statistic = 'indepsamplesT' using the coherence spectra as data? Or 

would I need to do a manual z-transformation like 

z1=atanh(Coh)-1/(dof1-2) beforehand? If I understood it right cant use 

cfg.statistic = 'indepsamplesZcoh' because it is just meant for within 

subject designs. Would I need to take tapers and segments into account 

for the degrees of freedom?<br><br>2. Would I need to correct for 

multiple comparisons when I use a Monte-Carlo aproach? If I would like 

to, could I just use the cfg.correctm='bonferroni' or 'fdr' option in 

fieldtrip? 3. I think I saw other groups just using a parametric chi-square test, would you consider this aproach correct too? 4.

 Would it be valid to conduct a repeated measures ANOVA first with GROUP

 as between-subject effect and frequency bins as within-subject effect?<br><br>5. Could I use the parametric tests (3. and 4.) after a z-transformation?<br><br>I will be very happy about any suggestions and opinions. Thank you very much.<br>Best regards<br>Johannes

                                          </div></body>

</html>