<div dir="ltr">


        
        
        
        


<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%">Dear Fieldtrippers,</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%"><br>
</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%">I'm encounter the
problem with MRI interpolation and reslicing using</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%"><font color="#228b22"><font face="lucidatypewriter, serif"><font style="font-size:10pt" size="2">FT_VOLUMERESLICE.
</font></font></font>
</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%"><font color="#000000"><font face="lucidatypewriter, serif"><font style="font-size:10pt" size="2">I
have read my MRI from fif.file and this mri variable contains</font></font></font></p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%">mri_K0012.unit, 'm'</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%">mri_K0012.dim, [432,
512, 180]</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%">mri_K0012.anatomy,
<432, 512, 180 int16></p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%">mri_K0012.hdr, (1*1
structure)</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%">mri_K0012.transform,
(4*4 double)</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%">mri_K0012.coordsys
'neuromag'.</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%"><br>
</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%">Than I used</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%"><br>
</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%"><font color="#000000"><font face="lucidatypewriter, serif"><font style="font-size:10pt" size="2">mri
= ft_volumereslice([], mri);</font></font></font></p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%"><br>
</p>
<p style="margin-bottom:0in;line-height:100%"><font color="#000000"><font face="lucidatypewriter, serif"><font style="font-size:10pt" size="2">the
output is </font></font></font>
</p>
<pre class=""><br>
</pre>
<pre class="">“the input is volume data with dimensions [432
512 180]</pre>
<pre class="">reslicing from [432 512 180] to [256 256 256]</pre>
<pre class="">the input is volume data with dimensions [256
256 256]</pre>
<pre class="">the input is volume data with dimensions [432
512 180]</pre>
<pre class="">selecting subvolume of 0.0%</pre>
<pre class="">reslicing and interpolating anatomy</pre>
<pre class="">interpolating</pre>
<pre class="">??? Attempted to access sel(1); index out of
bounds because numel(sel)=0.</pre>
<pre class=""><br>
</pre>
<pre class="">Error in ==> ft_sourceinterpolate>my_interpn
at 663</pre>
<pre class="">  ft_progress(sel(1)/num, 'interpolating
%.1f%%\n', 100*sel(1)/num);</pre>
<pre class=""><br>
</pre>
<pre class="">Error in ==> ft_sourceinterpolate at 583</pre>
<pre class="">          av( sel) = my_interpn(fv, ax(sel),
ay(sel), az(sel), cfg.interpmethod,</pre>
<pre class="">          cfg.feedback);</pre>
<pre class=""><br>
</pre>
<pre class="">Error in ==> ft_volumereslice at 176</pre>
<pre class="">resliced = ft_sourceinterpolate(tmpcfg, mri,
resliced);”</pre>
<pre class=""><br>
</pre>
<pre class="">I'm using matlab 7.6.0 (R2008a) and recently
downloaded fieltrip (also in my previous version of 2013 the error
was the same).</pre>
<pre class=""><br>
</pre>
<pre class="">I'd be thankful for the comments.</pre>
<pre class=""><br>
</pre>
<pre class="">Best Regards,</pre>
<pre class="">Olga.</pre>
<pre class="">P.S.Actually, I can project  my sources
meaningfully into not interpolated MRI, altoough the images are
plotted upside down. 
</pre>

</div>