<div dir="ltr"><div><div><div><div>Hello again,<br><br></div>I've just realized the question in my previous e-mail is irrelevant when I proceed with ft_connectivityanalysis instead, using 'granger' as the method. I wasn't aware that this function could also perform nonparametric granger methods.<br><br></div>Still, if anyone has insight on this or would like to connect about approaches, I'd love to hear.<br><br></div>Best,<br></div>Helen<br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Oct 28, 2015 at 6:37 PM, Helen Wieffering <span dir="ltr"><<a href="mailto:helen.wieffering@gmail.com" target="_blank">helen.wieffering@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div><div><div><div><div>Dear Fieldtrip Users,<br><br></div>I am trying to use the function ft_connectivitiy_csd2transfer in order to compute non-parametric Granger Causality measures. <br><br></div>In order to do so, I have my frequency analysis data in the following form: <br>freq = <br><br>        label: {129x1 cell}<br>       dimord: 'chan_freq_time'<br>         freq: [4 4.5000 5 5.5000 6]<br>         time: [1x41 double]<br>    powspctrm: [129x5x41 double]<br>     labelcmb: {8256x2 cell}<br>    crsspctrm: [8256x5x41 double]<br>          cfg: [1x1 struct]<br><br></div>In my data, the crsspctrm matrix has a dimord of chan_freq_time -- however, the function ft_connectivity_csd2transfer requires a dimord of chan_chan_freq(_time).<br><br>Does anyone have insight on how to change the dimord of my data? <br><br>I understand that Fieldtrip's ft_freqanalysis function treats (a, b) and (b, a) cross spectra as identical and therefore omits half of all possible combinations. Ideally, though, I'd like for my crsspctrm matrix to contain all possible combinations between channels, including the auto-spectra.<br><br></div>Thanks for your help!<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br><br></font></span></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888">Helen Wieffering<br></font></span></div><span class="HOEnZb"><font color="#888888">Bowdoin College<br><div><div><div><br><br></div></div></div></font></span></div>
</blockquote></div><br></div>