<div dir="ltr">Hi Marta,<div>It's correct that you can get negative values with dwPLI compared to classic PLI, it's indeed due to the debiasing procedure which involves a linear subtraction. What you want to do with it, depends on how you want to evaluate statistical significance. I wouldn't take the absolute values, though.</div><div>- You could add a fixed value to all dwPLI values to have everything above zero with a fixed shift, then do a baseline correction such as percent signal change or dB (which you can't do with negative numbers). This is a bit crude though, and I actually wonder whether it's "allowed".</div><div>- Just use the values as they are, with some being negative, if you want do condition comparisons, and use permutation testing with condition label shuffling at the group level to asses statistical difference between conditions.</div><div>- Convert the dwPLI values to a z-score within-subject through permutation testing, where you shuffle one phase-angle vector of one of the two channels with respect to the other in e.g. 1000 permutations, thereby creating a null-distribution under the null-hypothesis of chance-level dwPLI, to which you can compare you're observed dwPLI. This approach is blind to the fact that some values are negative. How/what you shuffle depends on whether you compute dwPLI over trials or over time.</div><div><br></div><div>Good luck,</div><div>Joram</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Tue, Oct 13, 2015 at 5:59 PM, Rodrigo Montefusco <span dir="ltr"><<a href="mailto:rmontefusco@med.uchile.cl" target="_blank">rmontefusco@med.uchile.cl</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hello...anybody any guess, explanation? I getting some too...close to zero thought, but still negatives.<br><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Feb 16, 2015 at 9:09 AM, Marta Bortoletto <span dir="ltr"><<a href="mailto:marta.bortoletto@cognitiveneuroscience.it" target="_blank">marta.bortoletto@cognitiveneuroscience.it</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div style="color:#000;background-color:#fff;font-family:HelveticaNeue,Helvetica Neue,Helvetica,Arial,Lucida Grande,sans-serif;font-size:13px"><div>Dear Community,</div><div dir="ltr">I am using the debiased wPLI to estimate connectivity between 70 EEG electrodes. I have about 150 trials for each subject. I noticed that some values of my 70x70 dwPLI matrix are negative. My understanding is that all values should be between 0 and 1, but for some reason I can get negative values from the debiasing process. My question is: Shall I calculate the absolute value of these negative values? Otherwise what shall I do with them? </div><div><br><span></span></div><div dir="ltr"><span>Thank you in advance for your help.</span></div><span><font color="#888888"><div dir="ltr"><span>Marta</span></div><div dir="ltr"><span></span></div><br></font></span></div></div><br>_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" target="_blank">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" rel="noreferrer" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br></blockquote></div><br></div></div>
<br>_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" rel="noreferrer" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br></blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">Joram van Driel, PhD<div>Postdoc @ Vrije Universiteit Amsterdam</div><div>Cognitive Psychology</div><div><br></div></div></div></div></div></div></div>
</div>