<html dir="ltr">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1">
<style type="text/css" id="owaParaStyle"></style><style type="text/css"></style>
</head>
<body fpstyle="1" ocsi="0">
<div style="direction: ltr;font-family: Tahoma;color: #000000;font-size: 10pt;">Hi Jan Matthijs,
<div><br>
</div>
<div>I do not think that the problem lies in the size of the jump: when I artificially create a very large jump in my data the jump is also not detected, see code.</div>
<div><br>
</div>
<div><span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8000001907349px; background-color: rgb(255, 255, 255);">data_short.trial{1}(132,1:700)</span><wbr style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8000001907349px; background-color: rgb(255, 255, 255);"><span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8000001907349px; background-color: rgb(255, 255, 255);">=0;
 %channel 132 is MRC11</span><br style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8000001907349px; background-color: rgb(255, 255, 255);">
<span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8000001907349px; background-color: rgb(255, 255, 255);">data_short.trial{1}(132,701:</span><wbr style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8000001907349px; background-color: rgb(255, 255, 255);"><span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8000001907349px; background-color: rgb(255, 255, 255);">1441)=1;
 %data 'jumps' up to 1 and stays there (massively bigger jump than actual squid jump).</span></div>
<div><span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8000001907349px; background-color: rgb(255, 255, 255);">You are right that if the 'muscle' algorithm picks up the jump, there is no problem. However, I don't know if this
 algorithm picks up the jumps consistently. (I did find 10 jumps in one dataset and zero in another, which I know is plausible but still).</span></div>
<div><span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8000001907349px; background-color: rgb(255, 255, 255);"><br>
</span></div>
<div><span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8000001907349px; background-color: rgb(255, 255, 255);">About my code: could you refer me to the newer version of the code? The code I use was on the fieldtrip tutorial </span><span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8000001907349px; background-color: rgb(255, 255, 255);">(</span><font color="#222222" face="arial, sans-serif" style="font-size: 13.3333330154419px;"><span style="font-size: 12.8000001907349px;">http://www.fieldtriptoolbox.org/tutorial/automatic_artifact_rejection).</span></font><span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8000001907349px; background-color: rgb(255, 255, 255);"> </span></div>
<div><span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8000001907349px; background-color: rgb(255, 255, 255);"><br>
</span></div>
<div><span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8000001907349px; background-color: rgb(255, 255, 255);">Best,</span></div>
<div><span style="color: rgb(34, 34, 34); font-family: arial, sans-serif; font-size: 12.8000001907349px; background-color: rgb(255, 255, 255);">Mats</span></div>
</div>
</body>
</html>