<div dir="ltr"><div><div><div>Dear Zsolt<br></div><div>I experienced difficulties and encountered many pitfalls along the way too. What exactly will your metric be? wPLI of post onset versus baseline difference/ratio? wPLI difference of the two conditions? Do you common average re-reference your data before?<br></div><div>The statistics that you will use will depend on your design. I would personally try a non-parametric design where you shuffle the index of the trials of one condition (if you do wPLI1-wPLI2) and consider the proportion of iterations exceeding the measured wPLI difference. Please consider though that both conditions should have the same number of trials.<br><br></div>Could you attach the programming attempts that you tried so far together with the exact error outputs?<br><br></div>I hope this helps so far.<br></div>Cris Micheli<br><br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, May 13, 2015 at 5:28 PM, Zsolt Turi <span dir="ltr"><<a href="mailto:zsoltturi@gmail.com" target="_blank">zsoltturi@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><p class="MsoNormal"><span style="font-family:Arial,sans-serif" lang="EN-US">Dear all,</span></p>

<p class="MsoNormal"><span style="font-family:Arial,sans-serif" lang="EN-US"> </span></p>

<p class="MsoNormal" style="text-align:justify"><span style="font-family:Arial,sans-serif" lang="EN-US">I would like
to perform a cluster-based permutation test on weighted phase lag index values by
using a within-subjects experimental design. I have two conditions (congruent
and incongruent one) and my goal is to compute WPLI between certain channel
combinations (FCz and F3 for instance) and see the WPLI change let’s say in 3-9
Hz and -100 to 500 ms between the two conditions. </span></p>

<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:0.0001pt"><span style="font-family:Arial,sans-serif" lang="EN-US"><br></span></p><p class="MsoNormal" style="margin-bottom:0.0001pt"><span style="font-family:Arial,sans-serif" lang="EN-US">I experienced some difficulties a</span><span style="font-family:Arial,sans-serif">fter the point when I calculated the WPLI data for each participant. To perform the above-mentioned comparison, shall I use ‘</span><span style="font-family:Arial,sans-serif;color:black">ft_freqstatistics’for the cluster-based permutation test?</span></p>

<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:0.0001pt"><span style="font-family:Arial,sans-serif;color:black" lang="EN-US"> </span></p>

<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:0.0001pt"><span style="font-family:Arial,sans-serif;color:black" lang="EN-US">If
I am right, which command shall I use to organize individual WPLI data, in
order to create a correct input for </span><span style="font-family:Arial,sans-serif" lang="EN-US">‘<span style="color:black">ft_freqstatistics’.
According to the tutorial, in case of time-frequency data it is ft_freqgrandaverage.
However, if I use it for WPLI data, I have the following error: “This function
requires freq data as input”.</span></span></p>

<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:0.0001pt"><span style="font-family:Arial,sans-serif;color:black" lang="EN-US"> </span></p>

<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:0.0001pt"><span style="font-family:Arial,sans-serif;color:black" lang="EN-US">Could
you please recommend me a tutorial, reference documentation or some comment on this issue?</span></p>

<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:0.0001pt"><span style="font-family:Arial,sans-serif;color:black" lang="EN-US"> </span></p>

<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:0.0001pt"><span style="font-family:Arial,sans-serif;color:black" lang="EN-US">Thanks
for any suggestions in advanced and let me know if the </span><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:Arial,sans-serif">description</span><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:Arial,sans-serif"> of </span><span style="color:black;font-family:Arial,sans-serif">my problem is not clear!</span></p><span class="HOEnZb"><font color="#888888">

<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:0.0001pt"><span style="font-family:Arial,sans-serif;color:black" lang="EN-US"> </span></p>

<p class="MsoNormal" style="margin-bottom:0.0001pt"><span style="font-family:Arial,sans-serif;color:black" lang="EN-US">Zsolt</span></p><div><br></div>-- <br><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div>************************************************************</div><div>Ph.D. student</div><div>Department of Clinical Neurophysiology<br>Georg-August University, Göttingen<br>Robert-Koch-Str. 40<br>37075 Goettingen</div><div>Web: <a href="http://www.uni-goettingen.de/en/222525.html" target="_blank">http://www.uni-goettingen.de/en/222525.html</a></div><div>************************************************************<br></div></div></div></div></div>
</font></span></div>
<br>_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br></blockquote></div><br></div>