<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div class="">Hi,</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">When working with Fieldtrip it is very convenient to store the data and analyses using MATLAB’s save and load functions. However, for large and/or complex data with many channels (>2GB) MATLAB enforces compression, which is pretty useless for
 electrophysiology data and slows down the load and save performance by a factor of up to 8 (see e.g. <a href="http://undocumentedmatlab.com/blog/improving-save-performance" class="">http://undocumentedmatlab.com/blog/improving-save-performance</a>). The MATLAB
 file format is based on HDF5, which is generally an open and future-proof data format, but unfortunately MATLAB doesn’t allow you to disable the compression.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">An option to overcome this could be to develop a simple data format for Fieldtrip data that is also based on HDF5. Is or has there been any development going into that direction? Would there be any interest? Of course, creating yet another data
 format is almost never a good idea (<a href="https://xkcd.com/927/" class="">https://xkcd.com/927/</a>), but since HDF5 is well-documented and readable with almost any software, it might be worth thinking about it. </div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">I’d be happy to hear your thoughts.</div>
<div class=""><br class="">
</div>
<div class="">Joscha</div>
<br class="">
<div apple-content-edited="true" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">
---------------------------------<br class="">
Joscha Schmiedt<br class="">
PhD Student<br class="">
<br class="">
Ernst Strüngmann Institute (ESI) for Neuroscience<br class="">
in Cooperation with Max Planck Society<br class="">
Deutschordenstraße 46 <br class="">
60528 Frankfurt am Main<br class="">
Germany<br class="">
<br class="">
Tel.: +49 (0)69 96769 241<br class="">
<br class="">
Sitz der Gesellschaft: Frankfurt am Main<br class="">
Registergericht: Amtsgericht Frankfurt - HRB 84266<br class="">
Geschäftsführer: Prof. Dr. Pascal Fries</div>
</div>
</div>
<br class="">
</body>
</html>