<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=Windows-1252">
</head>
<body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;">
Hi Tolga,
<div><br>
</div>
<div>There’s a layout that ‘better fits’ the projected channel locations, and which you can obtain from the megconnectome software that accompanies the HCP MEG data. The software can be obtained from here:
<a href="http://humanconnectome.org/documentation/MEG1/meg-pipeline.html">humanconnectome.org/documentation/MEG1/meg-pipeline.html</a></div>
<div>If you download one of the packages and unzip it, you’ll find a ‘template’ directory. Inside, there’s a 4D248.mat file (note that you need the ‘4D248.mat’ in cfg.layout in that case), which you can use as a layout for visualization.</div>
<div><br>
</div>
<div>Best wishes,</div>
<div>Jan-Mathijs</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>
<div>
<div>
<div>On Mar 4, 2015, at 9:54 AM, Tolga Ozkurt <<a href="mailto:tolgaozkurt@gmail.com">tolgaozkurt@gmail.com</a>> wrote:</div>
<br class="Apple-interchange-newline">
<blockquote type="cite">
<div dir="ltr">
<p class="MsoNormal">Dear Fieldtrip list,</p>
<div> <br class="webkit-block-placeholder">
</div>
<p class="MsoNormal">I was seeing the MEG files uploaded by “Human Connectome Project”, which seem to be pre-processed by Fieldtrip. The resting data were collected in supine position with 4D Neuromag 248 channels.</p>
<div> <br class="webkit-block-placeholder">
</div>
<p class="MsoNormal">When I use the standard command for layout</p>
<div> <br class="webkit-block-placeholder">
</div>
<p class="MsoNormal">cfg.layout       = '4D248.lay';</p>
<div> <br class="webkit-block-placeholder">
</div>
<p class="MsoNormal">the channel locations do not seem to fit. (Please see the attached figure). I do not quite know the channel distribution of the system; but it seems some channels are out of the head.  </p>
<div> <br class="webkit-block-placeholder">
</div>
<p class="MsoNormal">Could you give me an idea to project the channel layout properly?</p>
<div> <br class="webkit-block-placeholder">
</div>
<p class="MsoNormal">Thank you.</p>
<div> <br class="webkit-block-placeholder">
</div>
<p class="MsoNormal">Tolga</p>
<div><br>
</div>
-- <br>
<div class="gmail_signature">
<div dir="ltr">Tolga Esat Özkurt, PhD<br>
<i>Department of Health Informatics<br>
Middle East Technical University</i><br>
<a href="http://www.metu.edu.tr/~ozkurt/" target="_blank">http://www.metu.edu.tr/~ozkurt/</a><br>
<br>
</div>
</div>
</div>
<span><alpha_resting_data_example.jpg></span>_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</blockquote>
</div>
<br>
</div>
</div>
</body>
</html>