<div dir="ltr">Thanks a lot for the tip, <span style="font-size:12.8000001907349px">Jan-Mathijs. </span><div><span style="font-size:12.8000001907349px"><br></span></div><div><span style="font-size:12.8000001907349px">I started downloading it now.</span></div><div><span style="font-size:12.8000001907349px"><br></span></div><div><span style="font-size:12.8000001907349px">Best,</span></div><div><span style="font-size:12.8000001907349px"><br></span></div><div><span style="font-size:12.8000001907349px">Tolga</span></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Mar 4, 2015 at 12:34 PM, Schoffelen, J.M. (Jan Mathijs) <span dir="ltr"><<a href="mailto:jan.schoffelen@donders.ru.nl" target="_blank">jan.schoffelen@donders.ru.nl</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">



<div style="word-wrap:break-word">
Hi Tolga,
<div><br>
</div>
<div>There’s a layout that ‘better fits’ the projected channel locations, and which you can obtain from the megconnectome software that accompanies the HCP MEG data. The software can be obtained from here:
<a href="http://humanconnectome.org/documentation/MEG1/meg-pipeline.html" target="_blank">humanconnectome.org/documentation/MEG1/meg-pipeline.html</a></div>
<div>If you download one of the packages and unzip it, you’ll find a ‘template’ directory. Inside, there’s a 4D248.mat file (note that you need the ‘4D248.mat’ in cfg.layout in that case), which you can use as a layout for visualization.</div>
<div><br>
</div>
<div>Best wishes,</div>
<div>Jan-Mathijs</div>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<div>
<div>
<div><div><div class="h5">
<div>On Mar 4, 2015, at 9:54 AM, Tolga Ozkurt <<a href="mailto:tolgaozkurt@gmail.com" target="_blank">tolgaozkurt@gmail.com</a>> wrote:</div>
<br>
</div></div><blockquote type="cite"><div><div class="h5">
<div dir="ltr">
<p class="MsoNormal">Dear Fieldtrip list,</p>
<div> <br>
</div>
<p class="MsoNormal">I was seeing the MEG files uploaded by “Human Connectome Project”, which seem to be pre-processed by Fieldtrip. The resting data were collected in supine position with 4D Neuromag 248 channels.</p>
<div> <br>
</div>
<p class="MsoNormal">When I use the standard command for layout</p>
<div> <br>
</div>
<p class="MsoNormal">cfg.layout       = '4D248.lay';</p>
<div> <br>
</div>
<p class="MsoNormal">the channel locations do not seem to fit. (Please see the attached figure). I do not quite know the channel distribution of the system; but it seems some channels are out of the head.  </p>
<div> <br>
</div>
<p class="MsoNormal">Could you give me an idea to project the channel layout properly?</p>
<div> <br>
</div>
<p class="MsoNormal">Thank you.</p>
<div> <br>
</div>
<p class="MsoNormal">Tolga</p>
<div><br>
</div>
-- <br>
<div>
<div dir="ltr">Tolga Esat Özkurt, PhD<br>
<i>Department of Health Informatics<br>
Middle East Technical University</i><br>
<a href="http://www.metu.edu.tr/~ozkurt/" target="_blank">http://www.metu.edu.tr/~ozkurt/</a><br>
<br>
</div>
</div>
</div>
</div></div><span><alpha_resting_data_example.jpg></span>_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl" target="_blank">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a></blockquote>
</div>
<br>
</div>
</div>
</div>

<br>_______________________________________________<br>
fieldtrip mailing list<br>
<a href="mailto:fieldtrip@donders.ru.nl">fieldtrip@donders.ru.nl</a><br>
<a href="http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip" target="_blank">http://mailman.science.ru.nl/mailman/listinfo/fieldtrip</a><br></blockquote></div><br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><br><br></div></div>
</div></div>